Monthly Archives: noviembre 2009

Alianzas para la secuenciación

Según se anunció el pasado día 23, DNAVision (la mayor compañía proveedora de sistemas de secuenciación de última generación en Europa) y El Instituto de Genómica de Pekín (Beijing Genomics Insitute, que es el tercer centro más grande en estudios de genómica del mundo) se han aliado finalmente para mejorar su posición en el campo de la secuenciación de próxima generación ó “Next generation sequencing”. Es una alianza totalmente estratégica viendo el potencial de las firmas asiáticas.
DNAVision suministra tecnología de secuenciación para los sistemas Illumina y Roche GS FLX. Desde hace un tiempo ya se lleva anunciando estos sistemas (junto con el SOLiD de Applied Biosystems) como métodos de próxima generación. En realidad son actuales. Todos ellos se basan en la obtención de multitud de secuencias que generan un gran “pool” de datos, pasando de hablar de Megabytes a Gigabytes de información. Ahora se debería hablar del sistema IBM transistor como el Next Generation Sequencing Method principal.
Impresionante el avance de estos últimos 10 años. Dentro de poco casi podremos pedirla secuenciación de nuestro genoma como un análisis rutinario en la seguridad social XDD.

Android ha llegado

Finalmente tengo en mis manos mi nuevo terminal con Android. No parecía que fuera a ser tan intuitiva. La solidez y ergonomía del aparato me ha cautivado, viniendo de un mundo ya algo desfasado como es mi “antiguo” Nokia n95. También tiene que ver las tremendas ganas de adquirir un S.O. basado en Linux como es android. Eso sí, sin una conexión a la red el terminal se queda en pañales. Algo que sucede. A todos los nuevos móviles smartphones del mercado: las capacidades fotográficas se han dejado a un lado en pro de las tecnologías de la información. Sólo hace falta que el acceso lo subvencione el estado…XDD.
Habrá que trastear un poco para quitar las “huellas” de la operadora, configurarla a mi gusto…etc. Os dejo un vídeo en el que me identifico casi completamente (habla de forma algo distinta a mí XD). Disfrutádlo que no tiene desperdicio.

Hablando con científicos: Nobel de Física 2009

Hablando con científicosEn este episodio se conmemora de nuevo los premios Nobel de este año dando un repaso a la candidatura de Física y como siempre, se da un repaso a los logros y vida de los ganadores: Charles K. Kao, de Standard Telecommunication Laboratories, Harlow, Reino Unido, y de la Universidad de China en Hong Kong, por sentar la bases que llevaron a la transmisión de la luz en fibras para las comunicaciones ópticas, y conjuntamente, a Willard S. Boyle y George E. Smith, que trabajaban en Bell Laboratories, Murray Hill, Estados Unidos, por la invención del circuito semiconductor de imagen, el sensor CCD.
La entrevista de hoy se realiza en el Instituto de Física Aplicada del CSIC, allí hablaron con un experto en materia de fibra óptica, D. Pedro Corredera Guillén, investigador científico que pertenece al Grupo de Investigación de Tecnología para las Comunicaciones Ópticas.

Cardiomiopatías y el gen de la Nexilina

Estructura de un sarcómero

Estructura de un sarcómero

La Nexilina es una proteína que interviene en las contracciones musculares al situarse en el sarcómero, la unidad básica muscular. Los elementos móviles principales del sarcómero (actina y miosina) que generan el movimiento muscular están anclados en la zona que se denomina Discos Z. Se ha podido demostrar mediante estudios realizados en el pez cebra (menudo pececillo este, el de mi acuario está hecho un toro XD), que la estabilidad de las fibras musculares tiene que ver con esta proteína. Es como si se anclara en esos Discos Z y les da más robustez. Experimentaron mediante la generación de mutantes en ese gen para la Nexilina (NEXN) y se observó que los que tenían la proteína dañada perdían fuerza muscular y tenían el corazón más débil. Este estudio permitió relacionar la Nexilina con la desestabilización de los Discos-Z y, a su vez, la causa de la miocardiopatía que puede provocar una cardiomiopatía dilatada.

Referencias en Nature

El gen suicida contra el cáncer

Y la noticia es “Made in Spain”. El equipo de investigación del Departamento de Anatomía y Embriología Humana de la Universidad de Granada ha demostrado la posibilidad de reducir las dosis de los fármacos dedicados a la lucha contra el cáncer al usarse en combinación con terapia génica gracias al gen suicida E. Este gen provoca la muerte celular de las células tumorales que originan el cáncer de pecho, pulmón y de colon y previene además su crecimiento. Según dice Ana Rosa Rama Ballesteros, investigadora que ha llevado a cabo el estudio, el gen E induce la apoptosis (muerte celular) a través de daño en las mitocondrias de estas células tumorales. Los primeros estudios realizados han demostrado que se puede reducir hasta 100 veces la dosis de los fármacos utilizados en la quimioterapia combinados con la terapia génica, obteniéndose una inhibición del crecimiento tumoral de hasta un 21% en el caso del cáncer de pecho.
Vamos por el buen camino.
Referencias: Antonia Aránega Jiménez. Departamento de Anatomía y Embriología Humana de la Universidad de Granada.

Agitación y calor en las disoluciones

Disolución en agitación con calor

Disolución en agitación con calor

Algo básico a la hora de hacer alguna disolución (mezcla totalmente homogénea) es conocer algún truco sobre como llevar a cabo el proceso. Durante el desarrollo de un proyecto de investigación siempre hay que cacharrear un poco. Es algo fundamental para llegar a ser un experto en el manejo de todos los aparatos y componentes que se utilizan en un laboratorio. Además, se repasan ciertas clases de química a la hora de hacer los cálculos pertinentes para conocer las concentraciones, volúmenes, gramos o moles de uno o varios de los compuestos implicados en las disoluciones. Pero las primeras veces se suele escapar algo. Se está un buen rato agitando y aquello no se disuelve. Como los grumos del cola cao, vamos. En la gran mayoría de las ocasiones, basta con observar el pH del compuesto que se está originando. Regulando el pH suelen disolverse mejor los solutos. Pero en ocasiones se necesita dar un empujón mediante calor. Siempre hay que estar seguro de que la disolución no vaya a volverse inestable. En un laboratorio de Genética, a no ser de que se vaya a hacer algo muy específico y que contenga ácidos, las disoluciones no entrañan peligro. Pero ojo: hay que acordarse de cosas básicas como que la sosa genera cierta energía calorífica al contacto con agua. Hace un tiempo vi un pequeño susto con una solución de sosa en agua al poner el vaso de precipitados en un agitador que estaba demasiado caliente de una preparación anterior.
En la mayoría de los laboratorios es trabajo de los técnicos el tener preparadas las disoluciones, pero es bueno que de vez en cuando recordemos cómo se hace una simple disolución.

¿Miedo en la Universidad?

En España se da un miedo muy distinto que en los Estados Unidos. Aquí tan sólo se tiene miedo a la hora de hacer un examen. El respeto hacia los profesores ha ido cayendo. Y más cuando los profesores no lo imponen. Pero eso podría ser una ayuda más que un perjuicio. En la Universidad, sólo en la Universidad. Sin embargo En USA se ha llevado a cabo un estudio durante 5 años sobre el miedo de los estudiantes en los “Colleges” norteamericanos publicado como The College Fear Factor. Se ha destacado que allí el conocimiento de los doctores es muy determinante. Eso es como en todos los sitios. Pero su estudio se dirige hacia esos estudiantes menos aventajados que pueden ser considerados como que no dan la talla para estar allí pero que tan sólo huyen de dar una opinión o de promover una clase con dudas. Y etiquetarles también por el sistema educativo debe ser muy perjudicial para el futuro de la persona que se está formando. Se tienen datos de un grupo de estudiantes: los pertenecientes a clases de matemáticas y composición. Ellos tienen muy mal visto el fracaso y se exigen mucho más. Incluso se intentan hacer mesas redondas para que la enseñanza sea más interactiva y, a su vez, más equitativa entre todos los tipos de estudiantes.
Yo creo que ese miedo que tienen los estudiantes lo tienen todos en todo el mundo. Pero la cultura de cada país hace que se acentúe o que disminuya. En USA se sigue reconociendo como élite a la gente que va a la Universidad. Pero yo creo que lo peor es que los servicios prestados están demasiado bien pagados y que eso conlleva a mayores responsabilidades que aquí. En España, antes iban a la Universidad los que se lo podían permitir. Ahora cualquier adolescente que pertenezca a un nivel social medio tiene en mente el ir a la Universidad como continuación de su vida académica. Y con las becas que da el estado y los precios más asequibles que al otro lado del charco (también es de destacar el completamente distinto sistema económico norteamericano) el acceso es mayor. Soy de los que piensan en que se ha pasado de pensar en los que se quiere hacer a lo que la sociedad española dice que se debe hacer. Antes era conseguir un trabajo y formar una familia. Ahora consiste en ir a la Universidad y luego intentar tener un trabajo para pagar una hipoteca.
Lo que quería decir en este artículo es que los estudiantes siguen teniendo un miedo al fracaso pero, aunque va disminuyendo, sigue siendo equiparable a los Estados Unidos en cuanto a la carrera a cursar. Y que me gustaría saber qué pasaría en nuestro país si las ayudas económicas fueran similares.