La expresión génica desvelada en 3D

Estructura 3D del ADN
Científicos de Australia y los Estados Unidos han logrado nuevos avances en la comprensión de la estructura tridimensional del genoma, uno de los mayores desafíos que enfrenta actualmente el campo de la genómica y la genética. Sus conclusiones publicadas en la revista Nature Genetics, nos ofrecen nuevas directrices en el estudio de la expresión génica.

Alrededor de 3 metros de ADN se encuentra completamente plegado en el núcleo de cada célula de nuestro cuerpo. Este plegado permite que algunos genes sean «expresados» o activados, excluyendo o inactivando a los demás. El Dr Tim Mercer y el profesor John Mattick del Instituto Sydney’s Garvan de Investigación Médica y el Profesor John Stamatoyannopoulos de la Universidad de Washington analizaron la estructura 3D del genoma en alta resolución para comprender mejor la expresión génica.

Infografía de la estructura 3D del genoma
Infografía de la estructura 3D del genoma

Los genes de los organismos eucariotas superiores están compuestos de «exones» y de «intrones» (siendo los primeros las secuencias que codifican para proteínas y se expresan, y los últimos son secciones de ADN no codificante para proteínas). En el proceso de transcripción un gen, el ADN se transcribe en ARN, posteriormente las secuencias de intrones son eliminadas y los exones son empalmados de forma que se consigue una secuencia única que codifica una proteína. Dependiendo de los exones que se unen, el mismo gen puede generar diferentes proteínas.
Gracias a las grandes cantidades de datos proporcionadaos por el proyecto ENCODE, el Dr. Tim Mercer y sus colegas han obtenido interesantes observaciones junto con sus estudios del plegado del genoma encontrando que, incluso dentro de un gen, ciertos exones son fácilmente expuestos para interaccionar con la maquinaria biológica.

Esquema del proceso de transcripción incluyendo el splicing de los intrones para formar el ARN mensajero final
Esquema del proceso de transcripción incluyendo el splicing de los intrones para formar el ARN mensajero final. Pulsar para ampliar.
genome3dexpression-study
Imagen de una de las partes de este estudio sobre la estructura del genoma y la expresión génica.

«Imagine un largo e inmensamente complicado vid, sus ramas retorcidas que presentan algunas uvas para ser arrancados con facilidad, al tiempo que ocultan otras más allá de su alcance,» explica el Dr. Mercer. «Al mismo tiempo, imagine un recolector de frutas perezoso sólo recogiendo la uva a su alcance. El mismo principio se aplica en el genoma. Genes específicos e incluso los exones específicos, se sitúan en una posición que permitan ser alcanzados más fácilmente por la maquinaria biológica.»
En los últimos años, se ha podido observar cómo el plegamiento del genoma ayuda a determinar su expresión y regulación y este estudio proporciona la primera indicación de que la estructura tridimensional del genoma puede influir en el corte y empalme de los genes.
Los investigadores han llegado a la conclusión de que el genoma se pliega de tal manera que expone a la maquinaria de transcripción la zona promotora situada previa a los exones. Como si facilitara el trabajo a dicha maquinaria. Todo esto genera un punto de vista distinto al deducir que el genoma se dobla alrededor de la maquinaria de transcripción, en lugar de al revés. Los genes que entran en contacto con la maquinaria de transcripción consiguen formar sus tránscritos mientras que los que se encuentran lejos del acceso de esta maquinaria se ignorarían.
De nuevo, por el cruce de investigaciones distintas como el proyecto ENCODE y el estudio en 3D de la estructura de los genomas, se va conociendo mejor el apasionante mundo de la expresión de los genes. Incluso cambiando un poco el punto de vista que se tenía anteriormente. Interesante, ¿verdad?.

Referencias: DNase I-hypersensitive exons colocalize with promoters and distal regulatory elements, DOI: 10.1038/ng.2677

Continue reading

Blog de laboratorio tiene aplicación para Android

Para ya no tener excusa para leer algo de ciencia hemos decidido lanzar una aplicación para terminales Android (por ahora). ¡Que no se diga que la divulgación científica no está en la onda tecnológica!.
Blog de laboratorio en la Google play

Con una interfaz intuitiva y a elegir entre tonos oscuros o claros para facilitar la lectura, la aplicación de Blog de laboratorio permite leer los artículos del blog mucho más rápido que si se quiere acceder a la web, con un sistema de notificaciones ampliamente configurable (se pueden modificar los tonos, vibración y led de notificaciones al gusto. Y también se puede mantener desactivado si se prefiere), incluyendo la opción de controlar los intervalos de sincronización.
También se puede acceder directamente a todas las redes sociales activas (Twitter, Facebook y Google Plus) y, por supuesto, compartir cualquier artículo desde la misma interfaz sin esfuerzo gracias a la gran interoperabilidad que ofrece Android que permite conectar con casi todo tipo de programas instalados en el terminal móvil.

Capturas de pantalla de la aplicación de Blog de laboratorio
Capturas de pantalla de la aplicación de Blog de laboratorio. Pulsar para ampliar.

Poco a poco se irán ampliando las opciones para hacer una aplicación de lo más completa posible.
Lo dicho, más fácil no se puede: suscripción por el feed (ya sea con vuestro gestor o por email), seguimiento por Twitter, Facebook o Google plus y ahora mediante una aplicación totalmente gratuita.
Por cierto, podéis descargarla en la Tienda de aplicaciones de Google (Google play) desde el enlace que os pongo abajo y sirve para dispositivos con Android 2.2 (Froyo) o superior, así que no habrá problemas para casi nadie. ¿A qué esperas? Pruébala y comenta qué te parece.

[appbox googleplay com.blogdelaboratorio]

Continue reading

What is a gene?

Al igual que hice hace un tiempo para recordar lo que era el ADN, hoy quería compartir con todos vosotros otro vídeo igual de didáctico (y para nada pesado) de lo que es un gen. Sí, lo se, está en inglés. Pero es que hoy en día no se puede tener todo en español. Aunque os animo a probar la opción que incluye Youtube de traducir los subtítulos al español en la zona inferior del reproductor. Aunque sigue en fase beta, puede ser de un gran alivio para muchos.
Lo dicho…a cultivar esa mente, que más valen 4 minutos multimedia que una parrafada contada 😉

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=5MQdXjRPHmQ[/youtube]

Escuchando: lo último de Daft Funk

Continue reading

Easy DNA

easydna España
Desde que comentábamos la controversia de los test genéticos directos al consumidor, la fundación de empresas que se dedican a analizar nuestro querido material hereditario ha sido enorme. Hoy comentaremos una de estas compañías que ha aterrizado en España: Easy DNA. Es de destacar en primer lugar por la transparencia que ofrecen a la hora de ofertar sus pruebas de ADN.La dirección de cada una de las más de 35 oficinas repartidas por multitud de países a lo largo y ancho del globo está expuesta con sus formas de contacto e incluso un chat a disposición del cliente.
En su página web tienen todo detallado a la perfección: En cuanto a su catálogo de tests se encuentran pruebas de paternidad, pruebas de paternidad prenatal, pruebas legales de ADN, pruebas de parentesco, pruebas de perfil de ADN, pruebas de gemelos, pruebas de infidelidad, pruebas para el sexo del bebé, pruebas de maternidad y pruebas sobre predisposición genética. Además existe una opción que denominan “muestras discretas” que es para aquellos casos en los que la necesidad hace que la toma de muestras sea más a lo investigador privado con un amplio abanico de posibilidades para el análisis de ADN.

EASY DNA España

Otra cosa que dejan muy clara son tanto las tarifas como los métodos de pago. En todas las secciones dedicadas a cada prueba detallan el precio del test y los pasos a llevar a cabo en tal caso de que sean necesarios (como las pruebas destinadas a fines jurídicos). La posibilidad de abonar los importes tanto por tarjeta como por PayPal o transferencia bancaria se ha mejorado con la inclusión de la opción de pago contra reembolso, algo no demasiado usual y que también aporta confianza al consumidor.
Por último, la rigurosidad de todo este tipo de procesos siempre me ha hecho dudar de algunas compañías. En este caso, afirman que poseen una acreditación ISO17025, la cual es un más que aceptable sistema de calidad conforme los estándares internacionales de la ISO.

Cómo podéis observar la era del “ácido desoxirribonucleico” es una realidad desde hace años y easyDNA España se ha subido al carro de las grandes empresas dedicadas a las pruebas de ADN para aportar esa seguridad y fiabilidad que buscan sus clientes.

Continue reading

Uso de cookies

Este sitio web utiliza cookies para que usted tenga la mejor experiencia de usuario. Si continúa navegando está dando su consentimiento para la aceptación de las mencionadas cookies y la aceptación de nuestra política de cookies, pinche el enlace para mayor información. ACEPTAR

Aviso de cookies