SIDA, células madre e ingeniería genética

SIDA, células madre e ingeniería genética

Una persona berlinesa consiguió deshacerse del VIH (virus de inmunodeficiencia humana responsable del SIDA) tras un transplante al recibir células madre de un donante que era inmune de forma natural. Así es como comenzó una historia que ha revolucionado a parte de la comunidad científica que lucha por erradicar este mal que amenaza al ser humano.

En 2007, cierto habitante de la capital de Alemania tuvo la desgracia de ser diagnosticado de leucemia con el VIH a sus espaldas. Su médico de entonces y ligado a la Universidad de Berlín, Gero Huetter, conocía los estudios en los que se explicaba la relación de cierta inactivación completa de un gen con la inmunidad ante el VIH. Ese gen (denominado CCR5) controla un receptor de la superficie de las células (linfocitos) T CD4, por donde el virus penetra.

Representación del receptor CCR5 en la membrana.
Representación del receptor CCR5 en la membrana. Pulsar para ampliar.

La inactivación de ese gen de forma completa (con sus dos copias inactivadas en el genoma del individuo. Recordemos que cada gen tiene dos copias en nuestro material cromosómico) provoca la inmunidad ante el virus del SIDA. Gero Huetter hizo una búsqueda exhaustiva en las bases de datos de donantes buscando uno que fuera compatible con su paciente y que, además, tuviera ese gen inactivado de forma natural. Timothy Brown, que así se llama nuestro protagonista enfermo de leucemia e infectado por el VIH, ha estado libre de la carga viral desde poco tiempo después que se le realizara el transplante de células madre.

Distribución mundial de la prevalencia del VIH.
Distribución mundial de la prevalencia del VIH. Pulsar para ampliar.

A partir de aquí entran dos empresas biotecnológicas y una famosa universidad en busca del remedio anti-VIH.

Acción de las nucleasas con dedos de Zinc como sistema de anclaje a la secuencia a modificar.
Acción de las nucleasas con dedos de Zinc como sistema de anclaje a la secuencia a modificar. Pulsar para ampliar.

La empresa Sangamo realizó un estudio en 2009 donde se extrajeron linfocitos T CD4 de pacientes infectados y se trataron mediante la tecnología de nucleasas con dedos de Zinc. Para resumir, esas nucleasas son enzimas construidas a partir de unos dominios denominados Dedos de Zinc de unión al ADN y con enzimas de corte de ADN. Modificando esa capacidad de unión de los dedos de Zinc al ADN se pueden cortar las zonas del ADN que interesen ser escindidas. Esta tecnología permitió obtener en este estudio linfocitos T CD4 sin las copias del gen CCR5, siendo introducidos de nuevo en los pacientes de los que fueron extraídos.
Según se pudo leer en un artículo publicado el pasado mes de marzo, se determinó una mayor supervivencia de esas células modificadas y las personas que estaban siendo ya tratadas, al usarse esta técnica, mejoraron respecto a las que no recibieron los linfocitos modificados. Incluso uno de los pacientes redujo su carga viral tanto que era indetectable. Más tarde se supo que ese individuo tenía uno de los alelos de ese famoso gen CCR5 mutado, inactivado, demostrando la importancia de nuevo de poseer de forma natural esa modificación en el ADN. Uno de los problemas es la vida de los linfocitos T modificados ya que no son permanentes y tuvieron una duración de 48 horas, cosa limitante y que luego veremos que se tuvo en cuenta.

Pasando de compañía, Calimmune tuvo bien aprendida la lección de la duración de las células en el torrente sanguíneo y pasó a otro nivel: las células madre hematopoyéticas, esas células precursoras de las células sanguíneas y, por tanto, de los linfocitos T. Su excelente característica es que estos tipos celulares son permanentes.
En sus avances, la empresa hizo ensayos en individuos introduciendo tanto linfocitos T CD4 como ese tipo de células madre modificadas y presentando ese gen CCR5 inactivado. Pero para esta ocasión se utilizó otra tecnología a la hora de la modificación del ADN: el uso de vectores virales. Usando virus para eliminar otro virus. No quiero liar este post explicando la acción ya que es algo complicado puesto que se basa en el uso de lentivirus, cuyo material genético es RNA. Pero dejo una imagen de ese «silenciamiento» del gen mediante esta técnica para los más curiosos.

Ejemplo de la técnica de silenciamiento de genes mediante uso de vectores virales de Lentivirus
Ejemplo de la técnica de silenciamiento de genes mediante uso de vectores virales de Lentivirus. Pulsar para ampliar.

De este modo, lo que se intentaba era provocar que el organismo de la persona infectada por VIH se transformara en una fábrica de esos tipos celulares modificados y así curarse por sí mismas. Todos estos avances salieron a la luz el pasado agosto de forma fugaz afirmando que el uso de estas células también eran seguras.

Pero es que científicos de la Universidad de Harvard han entrado en acción y han utilizado otra tecnología llamada CRISPR/Cas para modificar las células madre de ratones e inferir esa cualidad que permita la resistencia ante el VIH. Lo mejor es que se ha avanzado en el uso de la técnica ya que se ha demostrado mediante secuenciación que el uso de este método provoca muy pocas variaciones fuera del gen que se quiere modificar. Vamos que es eficiente, cosa que se lee ya en el título del artículo publicado en octubre de este año 2014 en Cell Stem Cell «Efficient Ablation of Genes in Human Hematopoietic Stem and Effector Cells using CRISPR/Cas9».

Ejemplo de la acción de la tecnología CRISPR/Cas.
Ejemplo de la acción de la tecnología CRISPR/Cas. Pulsar para ampliar.

Más allá de las disputas entre empresas e investigadores (que las hay) sobre quién es mejor o qué técnica tendrá mayor rendimiento a nivel clínico (recordemos que todos estos estudios fueron a nivel preclínico e in vitro y que todas las técnicas generan errores), lo que quería mostrar es esa competencia que provoca un avance. Estudios en paralelo con un mismo objetivo, algo que un alemán y su eficiente médico animaron a iniciar y que ha generado un nuevo frente de batalla ante el VIH. Un final de guerra que puede verse colapsado por esas disputas. Interesante la naturaleza del ser humano, tan rica científicamente y tan desastrosa para nuestra vida en otros campos más ¿económicos?.

Referencias: ZFN technology for HIV/AIDS por Sangamo
Efficient Ablation of Genes in Human Hematopoietic Stem and Effector Cells using CRISPR/Cas9. Mandal, Pankaj K. et al. Cell Stem Cell , Volume 15 , Issue 5 , 643 – 652
Gene Editing of CCR5 in Autologous CD4 T Cells of Persons Infected with HIV
Pablo Tebas, M.D. et al. 2014. N Engl J Med; 370:901-910. March 6, 2014DOI: 10.1056/NEJMoa1300662

Wikimedia Commons.

Este post participa en la XXXIII edición del Carnaval de Biología, que hospeda @CEAmbiental en su blog Consultoría y Educación Ambiental«

Biocarnaval edición XXXIII

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Las mordeduras de serpiente son menos peligrosas

DNA-cobra

No es que las serpientes hayan ido perdiendo su peligrosidad o efectividad al actuar con sus colmillos. Las mordeduras de estos reptiles sí son un problema en determinados lugares del planeta y, sobre todo, afectan a gente con pocos recursos y conocimientos. La detección del tipo de veneno es clave para poder administrar un antídoto y cuanto más se sepa del atacante, menos peligrosa se vuelve su mordedura.

Así un conjunto de científicos europeos y nepalíes han generado un test de ADN que permite la detección del tipo de serpiente a partir de la mordedura. No es algo descabellado que, con las tecnologías que emergen en biotecnología, surjan nuevos test basados en ADN para cualquier tipo de detección. Siempre y cuando haya material genético, claro.
El estudio en el que se basaron los investigadores muestra el análisis de 194 muestras de mordeduras de serpiente en la zona del Nepal, región habitada por gente con pocos recursos y reconocida como uno de los lugares más peligrosos del planeta por la «actitud» de estos depredadores. 87 de esos ataques pertenecían a serpientes venenosas y casi el 50% tenían el sello de la cobra. Por cierto, 21 de esas víctimas acabaron pereciendo. Para los más curiosos, las muestras se tomaron con Desde Alemania, los resultados los muestran como muy prometedores. Sin embargo este trabajo aún no ha sido publicado en una revista científica y se conoce por su presentación en el «American Society of Tropical Medicine and Hygiene’s annual meeting» en New Orleans hoy 4 de noviembre de 2014.

Distribución de las serpientes a nivel mundial.
Distribución de las serpientes a nivel mundial. Pulsar para ampliar.

El verdadero problema de este test «detecta-serpientes» es el tiempo de análisis. La velocidad de diagnóstico ante una mordedura de serpiente es crucial. Y estos test no son para nada rápidos. La víctima moriría de la misma forma que sin test. Pero estamos ante una tecnología nueva y que ya han asegurado que se podrá hacer en poco tiempo una batería de reacciones a partir de sangre envenenada para disponer de los resultados en 20 minutos.

Desde mi punto de vista, y sin haber asistido a ese congreso, supongo que todo esto será más viable cuando se aumente el muestreo (el número y variedad de muestras tomadas). Y asome el recurso fundamental para todo desarrollo científico: el interés económico. Esperemos que al final, esto de detectar el tipo de serpiente sea tan sencillo como una medición de los niveles de glucosa. Ahora bien, llegar a dónde se disponga del antídoto… Será otro cantar.

Referencias: Abstracts and Education from «American Society of Tropical Medicine and Hygiene’s annual meeting»

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Sci Fest se descubre en Cuenca

SciFestCuenca

Cuenca, lugar desconocido para muchos y llamada la Muy Noble, Muy Leal, Fidelísima y Heroica tiene el honor de albergar el primer Sci Fest de la mano de la gente de Principia (de los que ya tendréis más noticias porque allí convergeremos los «Joferos«) los próximos 14 y 15 de noviembre de este 2014.

Allí se podrán ver en la palestra a todo un elenco de amantes de la divulgación cuyos currículos engrosarán al inaugurar esta iniciativa del #SciFestCuenca (apuntad el hashtag ;): José Ramón Alonso, Bernardo Herradón, Jose Antonio López Guerrero, José Manuel López Nicolás, Daniel Torregrosa. Carlos Romá-Mateo, Nahúm Méndez Chazarra, Julián Rodriguez, Marta Pérez Folgado, Manueal Seara, Ana Ribera Molinos y César Sánchez todos de la mano del que ha se ha partido los cuernos para que fuera posible: Enrique Royuela.

Web del Sci Fest de Cuenca
Pulsa para acceder a la Web del Sci Fest de Cuenca.

En el programa se puede observar que el objetivo, como siempre, es enseñar de forma clara la ciencia desde el ejemplo y debatir sobre la divulgación científica. Si os parece bien, os aconsejo llevar ropa cómoda porque no vais a querer moveros del sitio ni para comer. Y por si no se puede asistir, como siempre se podrá seguir todo el evento vía Twitter y también por streaming de vídeo.

Localización del #SciFestCuenca

Toda la información sobre este festival de cultura científica se puede encontrar en la web habilitada para ello. Si la duda de precio ha asomado por las neuronas, recordemos que es un evento COMPLETAMENTE GRATUITO, pero es necesaria una preinscripción (visible en la web) para que no se esté como sardinas en lata.

Sé que el chiste es fácil pero la expresión mirando pa Cuenca va a cambiar por completo ese fin de semana. La Ciencia está en todas partes.

ACTUALIZACIÓN

Aquí están los memes utilizados para difundir el evento.

ScieFestCuenca - Breaking bad Scifestcuenca - Sheldon Cooper Scifestcuenca - Sparta Scifestcuenca - Oprah Scifestcuenca - Futurama

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