La MTV está en los laboratorios

Una de las muestras de que los científicos de bata blanca estamos un poco locos es la serie de vídeos que vais a poder disfrutar a continuación. No se trata de canciones como la muy conocida «The PCR song«. Haremos un recorrido por versiones de Village People, Lady Gaga, Bruno Mars, Daft Funk, Queen y de hasta el coreano más famoso: PSY. Y es solo una muestra. Seguro que hay bastantes más publicados y muchos otros que sólo se pueden disfrutar de forma presencial. Doy fe de ello.

Empezamos con una de las antiguas. Se trata de una versión del YMCA de los Village People transformada en GTCA. Agarraos que va:

Siguiendo en antigüedad, sigo con una versión de uno de los grupos de científicos más activo en esto de dar ritmo al laboratorio. Se trata de los chicos de iGEM de Calgary y aquí tenemos su iGEM style, versión científica del Gangnam Style de PSY:

El archiconocido Bruno Mars también ha sido parodiado en favor de la ciencia. El título de esta versión de «The lazy song» es, com no podría ser otro, «The lab song«:

Ahora veamos como Queen ha inspirado para generar la Bohemian Rapsody más científica hasta la fecha. En este caso se conoce también como «The tale of a Post Doc«. Muy interesante en los tiempos que corren.

Pasemos a una de las féminas más laureadas por la generación MTV actual. Lady Gaga y su Applause tienen su versión parodiada de nuevo por la gente de iGEM de Calgary. El título: «Protocols«.

Para terminar, aquí está una de las últimas aportaciones muy de acorde al mundo bioinformático y que ha sido publicada al terminar el año pasado. Daft Funk puso el ritmo y salió «Debugging» de manos del RG-Group.

Como habéis podido ver, han sido seis versiones que mejoran considerablemente el panorama musical. Al menos cientificamente hablando. Si conocéis más, no dudéis en comentarlas por Twitter, Facebook, Google plus o añadiendo el enlace aquí mismo, en los comentarios. Las añadiré sin dudarlo. Y puede que, a este paso, haga un disco…Ummmh…¡Excelente idea!.

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El reconocimiento por una pasión

Premiados Innova 2013
Ayer Lunes 16 de diciembre de 2013 se celebró la gala de la entrega de los Premios Innova otorgados por el Diario de León a 7 empresas y científicos por su talento y excelencia innovadora. Pero también tuvo que ver la preocupación social. Una inquietud para que, tanto lo que hacen como sus aplicaciones, tenga incidencia de forma directa o indirecta en la población.

Ese «ruido» científico y tecnológico llamó la atención de un jurado muy variado (formado por José Luis Ulibarri Cormenzana, presidente de Diario de León, Adriana Ulibarri Fernández, consejera de Diario de León, José Angel Hermida, rector de la Universidad de León, Silvia Herrero León, responsable de Comunicación Castilla y León de Iberdrola, Marcos Gómez Hidalgo, subdirector de Operaciones de Inteco, Miguel Ángel Turrado, director de Estrategia y Tecnología de HP, Tomás Castro, director de Proconsi, Roberto Vidal Fernández, presidente de Empresas Innovadoras en Movilidad y Desarrollos Avanzados, Susana García da Cal, directora General de Telecomunicaciones de la Junta de Castilla y León, José Manuel Blanco Carrera, diputado de Nuevas Tecnologías y Joaquín Sánchez Torné, director del Diario de León, que actúo también como secretario).

Elección Premios Innova 2013
Elección Premios Innova 2013. Pulsar para ampliar.

Jurado que quiso reconocer esa pasión que tenemos los que manejamos la ciencia y tecnología a diario. Digo tenemos porque, como podréis comprobar en las imágenes y textos, fui galardonado con uno de los premios por mis labores en el campo de la Genética. Junto conmigo los 6 galardonados que me acompañaron fueron Jesús Méndez (que no pudo estar por su estancia en Nueva York) y su investigación genética del cáncer, Laura López Campano y el Grupo de Física de la Atmósfera de la Universidad de León en busca de la más exacta predicción meteorológica, los ingenieros Francisco Rodríguez Lera y Carlos Rodríguez que han desarrollado un pastillero para personas mayores basado en la realidad aumentada, David Mayo Turrado y todos los componentes del proyecto Daedalus por su colaboración con la NASA en un proyecto para conocer el Universo, la empresa Coterram y su inversión para producir energía con el serrín de los chopos de Benamariel y Proconsi y su proyecto para entrenar el ‘software del cerebro’ y ayudar a niños con problemas de aprendizaje han merecido los premios de la segunda convocatoria del galardón.

Premio agroalimentación 2013
Premio agroalimentación 2013

Quitando los tintes políticos evidentes como todo evento esconde sin ocultarse, la ceremonia fue muy familiar. Las cámaras y los aplausos no quitaron que los agradecimientos salieran sin problemas. Aunque la mayoría habían pensado qué decir, estoy seguro que no hubiera hecho falta. Como fue mi caso. Agradecer una trayectoria científico tecnológica es sencillo cuando no se quiere aburrir ni vender, cosa difícil de los grupos premiados pertenecientes a empresas (necesario en su caso). Esa facilidad de dar las gracias en parte es porque nos encanta lo que hacemos. Y eso, como en todas las profesiones, es un privilegio con el que todo el mundo sueña: ganarse la vida con algo que te guste. Aunque en estos momentos mi carrera se vea estancada por el mal momento económico, espero que este reconocimiento nos sirva a todos nosotros en un futuro. Porque no me cansaré de decirlo: la ciencia y la tecnología es lo que provoca nuestro avance.

Después de tanta parrafada, os dejo el artículo digital del Diario de León donde hace mención a la entrega. Si alguien quisiera leer el artículo al completo, puede adquirir el periódico vía online. Aunque lo más seguro es que lo añada en días futuros en este mismo post.

=ARTÍCULO EN EL PERIÓDICO==>Mentes en las que está el futuro ( Diario de León – 17/12/2013 )

Acaparando a los medios ;D
Acaparando a los medios ;D.

Como no era el momento de extenderse uno demasiado en el atril tras recibir el premio, dejé para estas líneas un agradecimiento a la que fue el nexo de unión entre algunos de los premiados con el Diario al recomendar nuestras entrevistas al periódico. Seguro que no la importa que grite ¡Gracias Marisa!. Y ¡Viva la Ciencia!

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Metagenómica para todos

Hace ya dos semanas que se celebró la II Semana de la ciencia de Astorga y ahora es un buen momento para recordar mi intervención como ponente aquel frío Martes. El título «Metagenómica para todos» deja bien claro que no se trata de una ponencia técnica. Se trató de explicar la metagenómica de un modo simple para un mejor entendimiento. Desde la propia definición de metagenómica hasta la metodología para realizar estudios metagenómicos y sus aplicaciones son las partes abordadas en la presentación.
¿Sabes qué es la metagenómica? Dale al play, descúbrela y comparte el vídeo.

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Dándolo todo en la II Semana de la Ciencia de Astorga

Pulsar para ampliar el cartel de la II Semana de la ciencia de Astorga.
Pulsar para ampliar el cartel de la II Semana de la ciencia de Astorga.

Como ya supisteis en el post anterior, esta semana se celebra la 2ª Semana de la ciencia de Astorga y para ello se abre un ciclo de ponencias que comienzan hoy lunes día 25 de noviembre y terminarán el sábado día 30. Una fiesta que también acogerá un concurso de relatos científicos. Pero primero vamos por partes. Aquí tenéis el programa completo de las ponencias:

Lunes 25 de noviembre:
“Extraer Energía de un Agujero Negro… ¿Posibilidad o Locura?”
Miguel Santander, científico y escritor nos hablará sobre astrofísica y presentará su libro “El Legado de Prometeo”
 
Martes 26 de noviembre:
“Metagenómica para todos”
Raúl de la Puente, investigador leonés, nos hablará sobre el mundo de la genómica y su análisis. (Este chico me suena de algo)
 
Miércoles 27 de noviembre:
“Puedes hacer (casi) cualquier cosa”
Pablo Núñez González, miembro del Fab Lab de León, nos hablará de impresión 3D y otras muchas cosas que se hacen en el FabLab.
 
Jueves 28 de noviembre:
“Psicofarmacología y metabolismo del etanol”
Alberto Vivó, del proyecto “The Big Van Theory” nos contará como la biotecnología puede ser muy interesante.
 
Viernes 29 de noviembre:
“Células madre: de la vida, la muerte y otras cosas”
Marisa Alonso Núñez, farmacéutica y científica astorgana nos hablará sobre diferentes aspectos de estos tipos de células.

Todas estas charas tendrán lugar en el Hotel Spa Ciudad de Astorga a las 8 de la tarde. Sin embargo todavía queda otra charla más y muy especial. Es la charla especial para niños que será el sábado día 30 en la ludoteca municipal.

Sábado 30 de noviembre:
“Tengo unas matemáticas y sé como usarlas”
Clara Grima, matemática sevillana dará una charla interactiva dirigida a niños, aunque los adultos aprenderán muchas cosas también.

 

Todo el evento se seguirá por las redes sociales y lo tuitearemos todo con el hashtag #cienciAstorga. ¿Que os gustaría verlo pero no estáis cerca? Pues nada, este año se tira la casa por la ventana y se puede disfrutar de un streaming cuyo vídeo se puede ver desde la ventana que dejo aquí abajo (no olvidéis compartirlo para que llegue a más gente).

Watch live streaming video from cienciastorga at livestream.com

Por último y para colofón de actividades, se convoca el I Concurso de Relatos Científicos de Astorga para los jóvenes inquietos por la ciencia con las siguientes bases:

El concurso contará con dos categorías:

Categoría A: De 10 a 13 años

Categoría B: De 14 a 17 años

En cada categoría habrá un ganador y otros dos finalistas. Todos ellos verán su relato publicado en el número de Enero de la revista Journal of Feelsynapsis junto con los escritos de grandes de la divulgación científica de España. Los ganadores además recibirán un lote de libros de temática científica.

Los trabajos deberán cumplir los siguientes requisitos:

-Serán sobre un tema de libre elección pero con un fondo científico. Se valorará la forma de contar ese tema y el hecho de que logre comunicar un tema científico suscitando el interés del público en general.
-Deberán tener entre 1000 y 1500 palabras.
-No se incluirán ni tablas, ni dibujos, ni imágenes de ningún tipo.
-Serán inéditos y no se habrán publicado con anterioridad en ningún sitio.
-El trabajo se mandará por email adjunto en un documento de texto a la dirección cienciastorga@gmail.com. En el asunto debe figurar “Participación concurso relato científico” y la categoría en la que participa. En el cuerpo del mensaje se escribirá el título del relato, los datos personales del autor, el colegio/instituto al que asiste y el nombre y teléfono de contacto de uno de sus padres o tutores legales.

Se recibirán trabajos hasta el día 20 de diciembre a las 16:00h.

Durante la evaluación de los trabajos, el jurado, formado por 5 divulgadores de la Revista Journal of Feelsynapsis nunca sabrá a quien pertenece cada relato. El fallo del jurado será inapelable y se adoptará como mínimo, por mayoría simple.

Los ganadores y finalistas se darán a conocer el día 4 de enero de 2014 en una charla que uno de los redactores de Journal of Feelsynapsis dará en Astorga.

[NOTA: Los premios pueden quedar desiertos. La participación en este Certamen implica la total aceptación de las presentes bases.]

Bueno, como muestra este vídeo de presentación de las jornadas donde se mezclan vídeos de las ponencias del año pasado con la información del programa de este año 2013. No, no soy ninguno de los que sale en el vídeo. Para verme, tendréis que esperar a mañana. ¡Venga! ¡Ya estáis tardando en compartir el artículo! ¡Que se entere todo el mundo!

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La semana de la ciencia más larga

Semana de la Ciencia 2013
Como todos sabréis (y si no, para eso está esta entrada), del 4 al 17 de noviembre se está celebrando la Semana de la Ciencia en España. Esta semana aglutina multitud de eventos a lo largo y ancho de la geografía española centrados en la ciencia: Museos, Universidades, centros de investigación, parques tecnológicos o empresas organizan exposiciones, cursos, visitas, talleres, mesas redondas, excursiones o conferencias, juegos por las calles, cafes con ciencia…etc. Todo para acercar a quien quiera la ciencia con la mejor herramienta para comprenderla: la divulgación desde los propios científicos. Si queréis, MEDIANTE ESTE ENLACE accederéis a una galería de fotos en Flickr con instantáneas tomadas el año pasado por toda España.
En el mapa que veis en la imagen siguiente, se han marcado la mayoría de los eventos relacionados con la semana de la ciencia y a los que podéis acceder fácilmente entrando AQUÍ y pinchando en cada globo de geoposicionamiento.

Mapa de la Semana de la Ciencia 2013
Mapa de la Semana de la Ciencia 2013. Pulsa para navegar por el mapa.

Esta iniciativa viene respaldada por la Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología (FECYT) y si necesitáis más información han destinado un teléfono de contacto y dos correos electrónicos que permitirán desgranar todas las dudas al respecto.

Información general: actividades@fecyt.es
Prensa: comunicacion@fecyt.es
Teléfono: 91.425.09.09

Pero aquí no acaba la cosa. En una semana tan larga y especial no se puede hacer de todo. Por eso, muy cerca de donde escribo, se está gestando una semana de la ciencia especial. Daremos un respiro a todos los locos de las artes científicas y a partir del día 25 de noviembre en Astorga se podrá seguir la buena onda investigadora. Y si todo sigue igual de bien, me podréis ver repartiendo un poco de saber genómico (cómo no ;)).
Si fuera por nosotros los científicos, seguramente cambiaríamos el nombre de la semana de la ciencia por el año de la ciencia. Sin duda. Si estáis en alguna de las sedes que se muestran desde www.semanadelaciencia.es, acercaos sin miedo. Lo peor que os puede pasar es que os empapéis de buen rollo y terminéis inquietando vuestro cerebro más de lo que pensáis.

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Ceremonia de los premios IG Nobel 2013

Escuchando uno de mis podcasts favoritos (como no podía ser de otra forma) me enteré que teníamos a nuestra disposición la entrega de los premios IG Nobel 2013 en su totalidad en el canal de vídeos más famoso del mundo. Para los que aún no lo sepáis, estos galardones se otorgan a los investigadores que han llevado a cabo los estudios más absurdos publicados durante el año pasado. No quiero este año poner los ganadores. Mejor ver la ceremonia. Una hora y media de lo más entretenida. A disfrutar de otro punto de vista científico 😉

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La expresión génica desvelada en 3D

Estructura 3D del ADN
Científicos de Australia y los Estados Unidos han logrado nuevos avances en la comprensión de la estructura tridimensional del genoma, uno de los mayores desafíos que enfrenta actualmente el campo de la genómica y la genética. Sus conclusiones publicadas en la revista Nature Genetics, nos ofrecen nuevas directrices en el estudio de la expresión génica.

Alrededor de 3 metros de ADN se encuentra completamente plegado en el núcleo de cada célula de nuestro cuerpo. Este plegado permite que algunos genes sean «expresados» o activados, excluyendo o inactivando a los demás. El Dr Tim Mercer y el profesor John Mattick del Instituto Sydney’s Garvan de Investigación Médica y el Profesor John Stamatoyannopoulos de la Universidad de Washington analizaron la estructura 3D del genoma en alta resolución para comprender mejor la expresión génica.

Infografía de la estructura 3D del genoma
Infografía de la estructura 3D del genoma

Los genes de los organismos eucariotas superiores están compuestos de «exones» y de «intrones» (siendo los primeros las secuencias que codifican para proteínas y se expresan, y los últimos son secciones de ADN no codificante para proteínas). En el proceso de transcripción un gen, el ADN se transcribe en ARN, posteriormente las secuencias de intrones son eliminadas y los exones son empalmados de forma que se consigue una secuencia única que codifica una proteína. Dependiendo de los exones que se unen, el mismo gen puede generar diferentes proteínas.
Gracias a las grandes cantidades de datos proporcionadaos por el proyecto ENCODE, el Dr. Tim Mercer y sus colegas han obtenido interesantes observaciones junto con sus estudios del plegado del genoma encontrando que, incluso dentro de un gen, ciertos exones son fácilmente expuestos para interaccionar con la maquinaria biológica.

Esquema del proceso de transcripción incluyendo el splicing de los intrones para formar el ARN mensajero final
Esquema del proceso de transcripción incluyendo el splicing de los intrones para formar el ARN mensajero final. Pulsar para ampliar.
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Imagen de una de las partes de este estudio sobre la estructura del genoma y la expresión génica.

«Imagine un largo e inmensamente complicado vid, sus ramas retorcidas que presentan algunas uvas para ser arrancados con facilidad, al tiempo que ocultan otras más allá de su alcance,» explica el Dr. Mercer. «Al mismo tiempo, imagine un recolector de frutas perezoso sólo recogiendo la uva a su alcance. El mismo principio se aplica en el genoma. Genes específicos e incluso los exones específicos, se sitúan en una posición que permitan ser alcanzados más fácilmente por la maquinaria biológica.»
En los últimos años, se ha podido observar cómo el plegamiento del genoma ayuda a determinar su expresión y regulación y este estudio proporciona la primera indicación de que la estructura tridimensional del genoma puede influir en el corte y empalme de los genes.
Los investigadores han llegado a la conclusión de que el genoma se pliega de tal manera que expone a la maquinaria de transcripción la zona promotora situada previa a los exones. Como si facilitara el trabajo a dicha maquinaria. Todo esto genera un punto de vista distinto al deducir que el genoma se dobla alrededor de la maquinaria de transcripción, en lugar de al revés. Los genes que entran en contacto con la maquinaria de transcripción consiguen formar sus tránscritos mientras que los que se encuentran lejos del acceso de esta maquinaria se ignorarían.
De nuevo, por el cruce de investigaciones distintas como el proyecto ENCODE y el estudio en 3D de la estructura de los genomas, se va conociendo mejor el apasionante mundo de la expresión de los genes. Incluso cambiando un poco el punto de vista que se tenía anteriormente. Interesante, ¿verdad?.

Referencias: DNase I-hypersensitive exons colocalize with promoters and distal regulatory elements, DOI: 10.1038/ng.2677

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Blog de laboratorio tiene aplicación para Android

Para ya no tener excusa para leer algo de ciencia hemos decidido lanzar una aplicación para terminales Android (por ahora). ¡Que no se diga que la divulgación científica no está en la onda tecnológica!.
Blog de laboratorio en la Google play

Con una interfaz intuitiva y a elegir entre tonos oscuros o claros para facilitar la lectura, la aplicación de Blog de laboratorio permite leer los artículos del blog mucho más rápido que si se quiere acceder a la web, con un sistema de notificaciones ampliamente configurable (se pueden modificar los tonos, vibración y led de notificaciones al gusto. Y también se puede mantener desactivado si se prefiere), incluyendo la opción de controlar los intervalos de sincronización.
También se puede acceder directamente a todas las redes sociales activas (Twitter, Facebook y Google Plus) y, por supuesto, compartir cualquier artículo desde la misma interfaz sin esfuerzo gracias a la gran interoperabilidad que ofrece Android que permite conectar con casi todo tipo de programas instalados en el terminal móvil.

Capturas de pantalla de la aplicación de Blog de laboratorio
Capturas de pantalla de la aplicación de Blog de laboratorio. Pulsar para ampliar.

Poco a poco se irán ampliando las opciones para hacer una aplicación de lo más completa posible.
Lo dicho, más fácil no se puede: suscripción por el feed (ya sea con vuestro gestor o por email), seguimiento por Twitter, Facebook o Google plus y ahora mediante una aplicación totalmente gratuita.
Por cierto, podéis descargarla en la Tienda de aplicaciones de Google (Google play) desde el enlace que os pongo abajo y sirve para dispositivos con Android 2.2 (Froyo) o superior, así que no habrá problemas para casi nadie. ¿A qué esperas? Pruébala y comenta qué te parece.

[appbox googleplay com.blogdelaboratorio]

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What is a gene?

Al igual que hice hace un tiempo para recordar lo que era el ADN, hoy quería compartir con todos vosotros otro vídeo igual de didáctico (y para nada pesado) de lo que es un gen. Sí, lo se, está en inglés. Pero es que hoy en día no se puede tener todo en español. Aunque os animo a probar la opción que incluye Youtube de traducir los subtítulos al español en la zona inferior del reproductor. Aunque sigue en fase beta, puede ser de un gran alivio para muchos.
Lo dicho…a cultivar esa mente, que más valen 4 minutos multimedia que una parrafada contada 😉

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=5MQdXjRPHmQ[/youtube]

Escuchando: lo último de Daft Funk

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Easy DNA

easydna España
Desde que comentábamos la controversia de los test genéticos directos al consumidor, la fundación de empresas que se dedican a analizar nuestro querido material hereditario ha sido enorme. Hoy comentaremos una de estas compañías que ha aterrizado en España: Easy DNA. Es de destacar en primer lugar por la transparencia que ofrecen a la hora de ofertar sus pruebas de ADN.La dirección de cada una de las más de 35 oficinas repartidas por multitud de países a lo largo y ancho del globo está expuesta con sus formas de contacto e incluso un chat a disposición del cliente.
En su página web tienen todo detallado a la perfección: En cuanto a su catálogo de tests se encuentran pruebas de paternidad, pruebas de paternidad prenatal, pruebas legales de ADN, pruebas de parentesco, pruebas de perfil de ADN, pruebas de gemelos, pruebas de infidelidad, pruebas para el sexo del bebé, pruebas de maternidad y pruebas sobre predisposición genética. Además existe una opción que denominan “muestras discretas” que es para aquellos casos en los que la necesidad hace que la toma de muestras sea más a lo investigador privado con un amplio abanico de posibilidades para el análisis de ADN.

EASY DNA España

Otra cosa que dejan muy clara son tanto las tarifas como los métodos de pago. En todas las secciones dedicadas a cada prueba detallan el precio del test y los pasos a llevar a cabo en tal caso de que sean necesarios (como las pruebas destinadas a fines jurídicos). La posibilidad de abonar los importes tanto por tarjeta como por PayPal o transferencia bancaria se ha mejorado con la inclusión de la opción de pago contra reembolso, algo no demasiado usual y que también aporta confianza al consumidor.
Por último, la rigurosidad de todo este tipo de procesos siempre me ha hecho dudar de algunas compañías. En este caso, afirman que poseen una acreditación ISO17025, la cual es un más que aceptable sistema de calidad conforme los estándares internacionales de la ISO.

Cómo podéis observar la era del “ácido desoxirribonucleico” es una realidad desde hace años y easyDNA España se ha subido al carro de las grandes empresas dedicadas a las pruebas de ADN para aportar esa seguridad y fiabilidad que buscan sus clientes.

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