Papers

Esta es una aplicación dirigida a admnistrar papers o artículos de investigación ó papers. Escribir la bibliografía cuando se está escribiendo un artículo para alguna revista o tesis es una tarea engorrosa para alguien novato en el tema. Este programa hace más fácil todo eso.
Primero hay que saber ciertas nociones a la hora de tratar con artículos de investigación. Como las canciones mp3, estos archivos en pdf, tienen la posibilidad de ser etiquetados. Estas etiquetas permitirán añadir datos como el nombre del artículo, autor o revista para que puedan luego catalogarse mejor. Este método de asignar las etiquetas es lo que da trabajo porque se tiene que hacer uno a uno si el archivo no las incluye.
Papers tiene integrado un buscador enlazado con ciertas bases de datos como Google o PubMed y permite importar directamente los pdf, siempre que se esté suscrito a la revista o el artículo sea libre. Mediante esta importación, las etiquetas ya están añadidas y no hace falta reescribirlas. De todas formas, siempre habrá algún paper perdido que necesite ser editado.
La interfaz es muy similar al iTunes en cuanto a aspecto. En el panel principal se pueden ver a la izquierda las bases de datos (ya sean nuestras o del exterior), en el medio las publicaciones listadas con una miniventana con la preview del artículo que esté seleccionado y junto con botones de acceso rápido para imprimir o abrir el pdf completamente. Y a la derecha está el panel donde se encuentra toda esa información de las etiquetas del artículo y que se puede modificar con simples clics de ratón.

interfaz del Papers

A la hora de añadir una cita bibliográfica lo único que hay que hacer es arrastrar al documento que queremos completar y listo. Todo esto es configurable. También se pueden hacer cosas como sincronizar con el iPhone, pero no lo voy a contar todo!.
Sin embargo hay una pega: es de pago. Son 29€ si eres estudiante. Pero siempre se puede bajar la versión de 30 días para probarlo. Hay otros productos como Mendeley Desktop que está tanto para Mac como para PC, pero todavía no les he hechado el ojo. No he hablado del EndNote porque estamos en crisis y ese sí que cuesta una pasta.

Referencia: Papers

Escuchando: F*ck me I’m famous podcast

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GTD para laboratorio

Ahora que he podido aprender la metodología del GTD (Getting things done) gracias a la ayuda de Berto Pena de ThinkWasabi y sus fantásticos screencasts, me he dado cuenta que desde hacía tiempo había utilizado un programa para Mac que se basaba en algo muy parecido: Lab Assistant.

imagen de LabAssistant en acción
imagen de LabAssistant en acción

Este software permite gestionar las tareas del laboratorio dividiéndolas en Cosas por hacer, recordatorios e incluso genera un log donde almacena todo lo que se ha ido recopilando quedando en un archivo de texto que puede servir como cuaderno de laboratorio digital.
Es una aplicación gratuita y desarrollada por el grupo de Mekentosj, famoso en creación de aplicaciones para uso en investigación. La única pega es que es una excusa más para estar pegado delante de la pantalla y el teclado, aunque en ocasiones haya que hacerlo.

Escuchando: nada de nada

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Adium 1.4

Para mejorar la productividad de los que tenemos ordenador propio en el trabajo, Adium es una gran ayuda. Es un cliente de mensajería que puede gestionar 20 tipos destintos de cuentas. Entre ellas están las de MSN y Yahoo Messenger, Facebook y, ahora, Twitter. Esta última es la que me ha ayudado mucho. La inclusión de esta red de microblogging en la última versión (aún beta) ha completado lo que yo pedía de un cliente TOTAL. Sólo falta la integración de Skype para quitarme el sombrero.
Este programa es multiplataforma y permite gestionar cada cuenta por separado. Además, las posibilidades de personalización son enormes. Y lo mejor de todo es que es totalmente libre. La mejor opción sin duda para mantener tus contactos sin que sea un estorbo para el trabajo.

Escuchando: el filtro del acuario.

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Posteando desde MacJournal

Acabo de dar con el fin de los dolores de cabeza que tenía. No dispongo de una conexión de internet en casa en estos momentos y, cuando quería postear algo, debía añadir más tiempo en el trabajo cuando acababa todo lo que tenía que hacer en el laboratorio. Esto hacía que mi horario laboral aumentara por falta de tiempo para el blog. Intenté lo de escribir en casa mediante la generación de una base de datos en el Mac y corría el WordPress de forma nativa en el portátil. Luego debía hacer corta-pega para poder publicar las entradas. Todos los clientes de wordpress decentes para Mac son de pago. Y tuve la suerte que un amigo me paso una licencia de este genial Gestor de contenidos. Tengo que agradecer a Miguel Angel Pedregosa su post sobre la configuración de MacJournal para WordPress.

Escuchando: Florence & the Machine – Kiss with a fist


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Actualizar blog de WordPress manualmente

He podido encontrar este fantástico manual que permite la actualización manual de un blog gestionado mediante WordPress.
Para actualizar manualmente el WordPress seguiremos estos pasos:
1ºPrimero hacer los backups (hay que ser precavidos), hacemos backup a la base de datos y a la carpeta wp-content (ahí se encuentra nuestro theme y toda nuestra configuración), para hacer backup de esa carpeta lo único que debemos hacer es descargar esa carpeta a nuestra PC, de preferencia con un cliente FTP como Filezilla.
2ºDescargamos la nueva versión de WordPress y obviamente la descomprimimos.
3ºPonemos nuestro blog en modo mantenimiento, deben tener cuidado con el archivo htaccess de preferencia tengan una copia del original en su PC.
Si queremos para mayor seguridad, podemos entrar a nuestro panel de WordPress y desactivar todos los plugins.
4ºDentro de la carpeta WordPress que hemos descargado y descomprimido, seleccionamos todas las carpetas y archivos menos la carpeta wp-content y con nuestro cliente FTP en este caso Filezilla, subimos esos archivos a nuestra carpeta raíz (public_html), nos preguntara si queremos sobrescribir le diremos que si.
5ºYa casi esta todo listo, ahora para finalizar iremos a la siguiente URL http://www.tublog.com/wp-admin/upgrade.php, queda claro que donde dice “tublog” se debe reemplazar por tu dirección, en esa dirección nos aparecerá un botón que dice update le damos clic y listo tenemos nuestro blog actualizado.
Hace un par de versiones este ultimo paso no ha sido necesario ejecutarlo, ya que cuando entraba a el me decía que ya no era necesario que mi blog ya estaba actualizado, así que si les aparece ese mensaje ya sabrán que lo pueden dejar ahí.
6ºComo último paso debemos activar nuestros plugins y quitar el modo mantenimiento.

Muy fácil y sencillo.

Fuente: Nivmar

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Exportando WordPress

Hoy he podido dar el paso: mi blog en dominio propio. Hasta ahora no veía con buenos ojos la administración de un sitio web personal pagando un dinerito a mayores. Pero la facilidad de esta herramienta de administración web junto con las tarifas de 1&1, me han hecho tirar para adelante.
Parece mentira pero sigue habiendo una gran descontrol en la nube sobre lo de tener un tutorial decente y actualizado en el tema de exportar tu web o blog de WordPress a un dominio nuevo. La mayoria de los sites te explican como cambiar la bitácora pero no a distinto servidor con distinto nombre. Me suena a «Corta-pega». De todas formas os lo explico tal y como lo he hecho yo y me funciona a la perfección. Que esto no tiene que ser una Biblia a seguir sí o sí. Ahí va:
1º Desactivar los plugins que estén instalados. Tan sólo desactivarlos, no desinstalarlos.
2º Hacer una copia de seguridad de la base de datos utilizando el gestor phpmyadmin que nos facilita el servidor. Esto está visible en los menús del CPanel correspondiente, en la opción de Bases de datos. A la hora de hacer el backup, seleccionar todas las tablas y estar seguro que el formato a exportar es SQL (aunque esté comprimido en zip o gzip).
3º Abrir este archivo generado por el phpmyadmin con extensión .sql y abrirlo con cualquier editor de texto. En la opción «buscar» del editor, encontrar todas las entradas en las que se encuentre el nombre del anterior dominio y reemplazarlas por el nuevo. Por ejemplo, si el site era http://miwebsite.host56.com y el nuevo es «http://miwebsite.com», poner en el recuadro de buscar el primero y poner debajo en reemplazar el segundo. De esta forma nos evitaremos instalaciones de plugins específicos con un par de golpes de teclado.
4º Bajarse TODOS los archivos y carpetas del servidor donde tengamos alojado el website. Guardarlos tal cual en una carpeta del ordenador.
5º Importar el archivo SQL generado a la nueva base de datos.
6º Subir al nuevo servidor TODOS los archivos que se obtuvieron en el paso 4.
7º Entrar en el Escritorio de administración del site pero ya en la nueva dirección.
8º Activar todos los plugins que se habían desactivado previamente. Revisar las configuraciones de cada uno por si la acción de los mismos tenía que ver con búsquedas o enlaces que podían seguir perteneciendo a la antigua dirección.
9º Actualizar los permalinks, que si no no podremos navegar más que en la página principal.

Bueno, pues eso era todo. No lleva más de 10 minutos, quitando las bajadas y subidas de los archivos a los servidores.

Escuchando: Podcast #53 de Macníacos

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Sistema Hackintosh

Este fin de semana pasado amplié un poco la capacidad de mi PC de sobremesa (más me gustaría poder comprar un Mac) y se me ocurrió la idea de mejorar el sistema hackintosh que ya tenía instalado. En el post sobre la instalación de leopard en PC que hice hace año y medio ya explicaba como hice, empíricamente, el proceso. Ahora tenía la intención de instalar en un sólo disco SATA de 500Gb Leopard (versión 10.5.7), Ubuntu (versión 9.04) y Windows XP (versíon Profesional con SP2). Intenté seguir los pasos que daban en la web de iAtkos. Pero con varios intentos no pude. Lo del arranque a mi sistema no le gustaba. Así que procedí a instalarlo con otro disco PATA que tenía de 80Gb. De esta forma, instalé (juer con la redundancia de la palabrita) primero Windows XP (editando aquí las particiones que quería. En mi caso creé 4 particiones: una para windows, otra para ubuntu y otras dos para ediciones de vídeo y almacén de archivos en formatos NTFS y Fat32) y Ubuntu en el disco SATA. Cuando acabó todo, me puse a instalar Leopard en el disco PATA. Generé, con la utilidad de Discos en la propia instalación, 2 particiones: una para Leopard y otra para meter cosas de mi investigación. Cuando terminó la instalación, el arranque para Leopard se había escrito en el mbr de ese disco PATA. Lo mejor de todo, es que Chamaleon V2 (que así se llama el gestor de arranque) adquiere todos los arranques que se han instalado en el ordenador. Así que sólo hay que configurar como disco de arranque ese en el que tengo Leopard y puedo iniciar el resto de sistemas operativos.
Una cosa importante a la hora de instalar Leopard es dar a la opción «customize» justo antes de empezar a instalar. Hay que activar cada driver que te convenga. Pero haciendo hincapié en el controlador PS/2, porque si no te quedas sin ratón y teclado (otra cosa es que tus dispositivos sean USB, pero aún así revisa los drivers USB por si acaso).
Todo quedó perfecto. Si teneís alguna duda o pregunta, comentádmela.

Escuchando: Podcast Hablando con científicos

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Instalación de Leopard en PC

Reorganizando el foro, me he encontrado con un tutorial que hice el año pasado sobre la instalación de Leopard en mi PC de casa. Os lo pongo por si os sirve de ayuda y si tenéis dudas, comentádmelas:

Lo más importante de todo es que este mini tutorial está dirigido para máquinas con chipset intel. Aunque se podría hacer la instalación en sistemas basados en AMD, yo no lo he podido comprobar.
Mi sistema esta basado en una placa Asus con chipset intel 945P+ y ICH7, procesador Intel Core 2 Duo 2.2Ghz, 2 Gb de RAM y tarjeta ATI X1550.
Después de muchas intentonas, lo único que tuve que hacer fué descargarme el archivo del DVD iAtkos 1.0R3 (cuyo torrent está en la zona Mac de la web). El paso más decisivo es tener claro lo que se va a hacer: En mi caso tengo 2 discos duros, uno IDE y otro SATA. Particioné el IDE para tener al menos 10Gb disponibles para la instalación.
Si sólo tenéis un disco duro y, seguro, se tiene otro S.O. (como el archiconocido Güindous) podeis instalarlo en alguna partición en ese disco. Pero hay que tener cuidado con el Arranque. El arranque de Leopard se superpondrá al de Güindous. Pero no lo habréis perdido. Sólo tenéis que pulsar F8 en el arranque y aparecerá la opción de elegir el sistema operativo.
De todas formas, al ser una versión crackeada, lo mejor es separar las instalaciones para que el arranque lo escriba en el disco duro de la instalación. Así sólo se tiene que elegir el disco duro en el arranque para empezar con un S.O. u otro.
Pues bien, aquí van los pasos que realicé desde que tenía la partición hecha y el DVD quemado:
1.-Arrancar la instalación desde el DVD (id a ver la tele. Tarda unos 10-15 minutos, dependiendo del sistema).
2.-Dar a aceptar o continuar hasta tener que elegir el disco donde instalar.
3.-Borrar la partición con la Utilidad de discos (Disk utilities) situada en la barra de herramientas superior en la opción de utilidades.
4.-Cliquear en la opción de avanzadas para elegir la casilla de borrar con ceros. Así se borrará todo lo que había en la partición. Despúes poner un nombre corto al disco y formatear como Mac OS Journaled. En unos 5 minutos habrá acabado.
5.-Salir de la utilidad de discos dando en el botón con la X y continuar. Aquí hay que elegir Customize para elegir las cosas a instalar. En mi caso tan sólo he cliqueado la casilla del Arranque. El resto, SE DEJA SIN MARCAR O SE DESMARCA LO QUE HAYA MARCADO. La opción de arranque que hay que marcar es la que pone MBR.
6.-Dar a aceptar o siguiente y esperar a que haya terminado la instalación (podéis dar a Skip para que no verifique el DVD de instalación y sea más rápido). En 15 minutos habrá acabado.

Si todo ha ido bien debería reiniciarse el sistema y cuando entreis en el arranque…tendréis Leopard en vuestro PC.

He tenido bastante experiencia en el tema y he probado con varias instalaciones y parches post-instalación. Y dio la casualidad que con este DVD lo hice al tun tun y salió a la perfección. De todas formás, si teneis algún problema, hacédmelo saber mediante un mensaje en el foro o un e-mail. Os contestaré rápidamente. Se lo que significa tener Leopard en el PC.

Un saludo a todos.

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Keynote Apple Septiembre 2009

Al regresar de las tremendas vacaciones en Punta Cana, aislado del mundo reconfortantemente, me he puesto a escuchar varios podcasts sobre la keynote de Apple del pasado Miércoles 9 de septiembre. Como era de esperar las ilusiones de muchos de que se sacara un Tablet se fue al garete. Qué se le va a hacer. Pero en un alarde de ingenio han sacado…un iPod nano con cámara de vídeo sin wifi. Impresionante. Suplen la idea de mejorar rotundamente el iTouch con la cámara y GPS con un aumento de RAM, procesador y disco duro de hasta 64Gb. Eso sí, han dado un golpe de efecto con la bajada de los precios. Ahora por 179€ puedes disfrutar de un iTouch de 8Gb. Pero el precio del nuevo iTouch de 32Gb es de 269€ y es muy doloroso para mi porque dudé mucho en pillar el iTouch hace 4 meses por relación capacidad precio con el Classic y al final adquirí este último. Por último han mejorado los Classic en capacidad aumentando hasta 160Gb y los Suffle en colorines.
Yo creo que debían haber incluído una cámara al menos en el iTouch. Más que nada porque, siendo el hermano mayor del nano, sería un empujón más para abarcar más mercado y agradar al público que lo pedía. Por lo demás, pienso que poco a poco la rueda de clic desaparecerá, que tengo curiosidad de ver como va esa dirección gammer que está promoviendo Apple con los dispositivos táctiles y que el Suffle nuevo me parece una pequeña cagadita. Esto lo explico desde un punto de vista práctico. Yo tengo un Suffle de los anteriores de 1Gb y estoy muy contento. Lo utilizo para ir a correr o cuando salgo a la calle y no quiero cargar con el Classic. Y la chorrada de tener que usar sí o sí los auriculares que te venden…pues eso, una cagada. Intentad salir a correr con los cascos que vienen de serie. Me río.
Muchas gracias a los podcasts de Emilcar y Frikeando.es por ayudarme a ponerme al día.

Escuchando: David Guetta – Sexy Bitch [Feat. Akon]

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