Calidad en los laboratorios

calidad en los laboratorios
Desde el momento en que escribí aquel artículo destinado a saciar curiosidades sobre cómo montar un laboratorio de forma sencilla (tanto como el laboratorio en sí), sabía que iban a llover una serie de comentarios. La mayoría fueron comparativos en cuanto a derroche en algunas instalaciones. Pero hubo gente que creyó que iba a ser una guía para montar un laboratorio competitivo a nivel de análisis.
Como bien sabe la mayoría de científicos, esto de bueno, bonito y barato en ciencia… como que no existe. Hay que darse cuenta que la calidad se obtiene en la especialización. Y esta especialización de los productos conlleva unos precios que pueden parecer elevados.
Con todo esto aparece el eterno debate. Que no es único en nuestro campo científico. Nos rodea en todo lo que usamos. ¿La calidad de un producto va en concordancia con el precio del mismo?, ¿si es más caro es mejor?. Según mi opinión, todo depende del uso. Si lo que buscamos es un aparataje que nos salve el trasero de algún que otro análisis de vez en cuando, uno a la semana, pues quizá no hace falta usar lo mejor. Pero en cuanto se necesitan hacer análisis exhaustivos y tener máquinas funcionando todo el día, se ha de buscar muy bien si no se quiere salir del presupuesto. Y sí, lo caro suele ser de lo mejor. Aunque siempre hay excepciones.
Por eso no está de más comparar casas comerciales. Y distribuidores. Una búsqueda que puede durar una tesis doctoral. O varias hasta ver que algo falla.
Existen multitud de empresas que se dedican a la distribución de material de laboratorio de calidad. Dar con la adecuada que venda esa calidad que buscamos y que también tenga una logística aceptable. Por no decir del servicio postventa. Vaya, si esto parece que es igual en todo lo que nos rodea: un coche, un portátil, una lavadora…al final queremos esas «tres B’s» del principio.
¿Habéis conseguido algún material o aparato de laboratorio que os haya sorprendido por su precio y prestaciones? Pero sorprendido de verdad. De no creerse que iba a ir tan bien. En mi caso podría decir algún que otro kit de PCR en pruebas y muestras para hacer distintos análisis. Porque, en esos casos, la rentabilidad estaba asegurada, si salía todo bien, al ser gratuitos. Lo que recuerdo es el caso contrario sí que me pasó: adquirir algo caro y bonito pero ser un fiasco. Y era una de las bases del análisis que trataba de llevar a cabo: obtuve unos tubos de ensayo para PCR la mar de monos derretidos en la placa térmica del termociclador.

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Y tú ¿qúe bata de laboratorio usas?

Como dicen que una imagen vale más que mil palabras, los chicos de PHD comics dejaron hace un tiempo estos dibujos con los estilismos más vistos en cuanto a batas de laboratorio se refiere.
batas de laboratorio

Como buen científico, me he visto en la tesitura de llevar todos los estilos que ahí se ven (y alguno más). Es lo que tiene usar alguna bata prestada en momentos determinados ;D.

Lo dicho: y tú ¿qué bata usas?

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Montando un laboratorio en casa

opuesto a eureka
Han pasado ya los años en los que entrar en un laboratorio de investigación era como un sueño. Mirar alrededor y observar, con los ojos como platos, maquinaria que habías visto en los libros, películas o incluso sólo oído hablar. Un acceso a los laboratorios que se sentía como algo exclusivo. Y no sólo porque te dejaran entrar con facilidad, si no por el difícil acceso que antes se tenía a la hora de poder adquirir material de laboratorio. Pero eso ha cambiado con una simple y conocida aliada: la compra online.

Yo soy de los que crecieron con películas de aventuras donde los inventos y los laboratorios hacían chiribitas mis ojos. Incluso aquel laboratorio de Dexter (que algo sí parece haber inspirado mi caricatura en el blog) me arrancaba una sonrisa durante la duración de los capítulos. Y no precisamente por las aventuras vividas, si no por ese ambiente de laboratorio montado de incógnito y que todos (o la mayoría) de los que nos encanta la ciencia hemos querido tener. Bueno, seguro que muchos de vosotros pedíais «juguetes» científicos cuyos nombres venían con sufijos como -cefa o -nova. Momento «remember». Ese era la mejor manera de montar un pequeño laboratorio en casa. Y coger algunos cacharros de la cocina.

Más tarde, cuando ya estás en el instituto y comienzas a ver más material de laboratorio en esas aulas de ciencias, la exclusividad también era palpable. Pero en muchos casos con la mirada asustadiza de los profesores en cuanto los alumnos manipulábamos instrumentos como probetas de cristal, los microscopios o una simple maqueta. Pobre gente. Sabían que conseguir más material de algo científico para la enseñanza no debía ser agradable. Lo digo por los fondos destinados.

¿Y qué pasó en la universidad? Mis experiencias son de principios de siglo (qué mal suena eso…pero sólo son 10 años). Las prácticas en los laboratorios también destacaban por las advertencias del material a utilizar. Aquellas micropipetas comunes que, aunque ya antiguas, se guardaban como oro en paño. Y que para utilizar algún instrumento verdaderamente interesante, tendrías que tener suerte o ser más agresivo e intentar meterte en algún grupo de investigación como alumno interno antes de terminar la carrera. Término de carrera que empalma con las primeras tomas de contacto de verdad en un laboratorio. Sólo voy a hablar del material y maquinaria, pero la planificación con la bata blanca va intrínseca en las labores científicas. No os olvidéis. Un entorno que se vuelve algo hostil fuera de la dirección de las prácticas dadas por esos mismos profesores que serán tus mentores. Aparatos caros, realmente caros por sólo destinarse para los laboratorios. Siempre nos quedamos con las diferencias de precios que existen entre un homogeinizador y una batidora de cocina, si en el laboratorio se va a usar para hacer cocinitas básicas y que no requieran ni mucha precisión ni mucho desgaste. O pedir un arcón frigorífico específico de laboratorio, o un lavabo. Todo un mundo.

paraíso de ldescanso en un laboratorio
Vista del paraíso del descanso en un laboratorio. Imagen de PHD Comics.

Pero ya comenzaron en aquella época las triquiñuelas de utilizar internet para adquirir material no proveniente de las casas comerciales científicas de forma directa: el mercado de segunda mano. Ese mercado que permitían reponer máquinas o aumentar el rendimiento del laboratorio por unos cuantos euros menos de lo que podía ser una ruina para el grupo de investigación. Un mercado que podría ser un poco oscuro pero que con eBay se permitió un flujo de productos inimaginable.
Pero eso puede haber pasado a la prehistoria. La verdad es que montarse un laboratorio en condiciones aún era difícil a golpe de clic y sin pasar por infinidad de registros en cada casa comercial. Sin embargo ¿cuál es la situación actual?. Ahora podemos estar seguros que por un puñado de euros y acceso a internet podemos tener en muy poco tiempo un laboratorio sencillo de calidad. Ya sabemos que comprar electrodomésticos es tan fácil que desde cualquier tienda especializada de venta online se puede adquirir ese aparataje tan específico como es un frigorífico, un microondas o un homogeinizador.

Pero vayamos a eso que nos importa: el verdadero material de laboratorio. Micropipetas, pipetas, tubos de ensayo, puntas de plástico, autoclaves, sistemas de electroforesis, centrífugas…etc. Tan sólo una simple búsqueda en un navegador nos puede llevar a un gran almacén de distribución conocido por todos y que venden prácticamente de todo. Y, sí, también encontraremos material de laboratorio a tutiplén. Veamos una compra simple para hacer, por ejemplo, un análisis de PCR básico. Para ello necesitaremos tubos de ensayo de 1,5 mL y 0,2 mL, un par de micropipetas con sus puntas de recambio, un termociclador y un sistema de electroforesis básico con su fuente de alimentación, agarosa y cinta para contener el gel. Yendo un poco más allá, añadiremos al carrito una centrífuga y unos soportes para los tubos de ensayo. Contando de que disponemos de electrodomésticos como un microondas y un frigorífico con congelador.

amazon-lab-shopping

Pues bien, si hacemos una selección de este material tirando por lo bajo y sin buscar la excelencia, un kit de laboratorio así puede costarnos a golpe de un clic sobre unos 2500$ (unos 1820€). Todo nuevo. Algo barato. Lo sé. Y el termociclador vale 1550€ él solito, algo que puede que de segunda mano lo encontremos más barato. Todo esto pensado para un laboratorio de muy bajo coste pero funcional al 100% y sin excesivos riesgos de contaminación (pero con dedos de frente).
Pero lo más curioso es que no he tenido que salir de la misma tienda, que nos suministra los productos de varios fabricantes. A todo esto habría que incluir reactivos de PCR y un marcador de pesos moleculares. A parte de la muestra. Pero en estas últimas «minucias», la experiencia es un grado y sabemos que hay que dirigirse a las casas comerciales y gastarse unos euros en condiciones. No os lo iba a poner tan fácil ¿verdad?.

ejemplo de compra para laboratorio

P.D.: Desde «Blog de laboratorio» advertimos que no nos hacemos responsables del desastre de resultados que pueden obtenerse con una compra así. Por favor, consulte con su científico favorito mediante email, redes sociales y…¡utilice los comentarios!. Gracias ;D

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Decoración navideña de laboratorio

Árbol navideño formado por cultivo de microorganismos.

Otro árbol de Navidad mediante cultivo de microorganismos.¿Qué científico loco no ha estado flipando con las figuras y colores que se forman cuando se hace un cultivo de microorganismos en placas de Petri? Pues ya se lleva haciendo un tiempo para dar color a la Navidad de una manera totalmente original.
Por ejemplo, el cultivo del árbol de navidad que sirve de portada está compuesto por Talaromyces stipitatus en lo más alto, Aspergillus nidulans como verde del árbol, Penicillium marneffei como decoraciones y Aspergillus terreus como tronco. Una familia de hongos muy particular y que puede alegrar la vista de forma sorprendente.

Aquí os dejo otro ejemplo de bolas de navidad para los árboles.

Varias placas de petri con cultivos de microorganismos coloristas a modo de adorno navideño.
Varias placas de petri con cultivos de microorganismos coloristas a modo de adorno navideño.

Una forma diferente de sacar partido a esos medios de cultivo que caducan y que no se es tiene demasiada fiabilidad. Y si se le ocurre a alguno, dos cosas: que se acuerde de sellarlo bien para que no dar problemas y que hagan una foto para compartirla con todos nosotros. ¡Dadle a la imaginación! ¡Feliz Navidad! ;D

Fuentes:
Seasonal Scientific Decor en «TrendHunter»
Tumblr de Geneticist
Assume Awesome

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El gran remedio antigolpes

Caida con golpe asegurado

La gran mayoría de las veces que nos damos un golpe relativamente fuerte y sobre todo en sitios del cuerpo muy visibles como la cabeza, inmediatamente corremos hacia el congelador a por hielo, bolsas térmicas heladas u otros alimentos congelados. El aplique es doloroso e incómodo. En el caso de la gente adulta nos preocupamos más porque no deje huella el golpe que otra cosa. Pero en los niños la cosa cambia. Los golpes dan más quebraderos de cabeza a los padres que el propio impacto del niño si lo hace con la testa. Además, intentad poner a un niño pequeño algo muy frío después de un golpe.

El hecho es que sí que existe algo que se puede aplicar inmediatamente tras un golpe, que no provoca desprecio ante cambios de temperatura y que sea más eficaz que ese remedio helado. Cuando se lleva a los niños a la guardería o al parque puede darse uno con la suerte de conocer ese remedio «oculto». Y es que este conocimiento no se adquiere tan fácilmente. Muchos padres no lo conocen. Se llama «la barrita esa de los golpes». Bueno, es el término coloquial de un stick muy parecido al pegamento de barra y que tiene el nombre comercial de Arnidol. Las abuelas lo describen como mágico. Y es normal. Golpe típico con chichón saliendo y ¡ZAS! es sacar la barrita, untar la zona sin que se entere «el cachorro» e inexplicablemente el hinchazón comienza a retroceder. Y, dependiendo de la rapidez en darlo y el tipo de golpe, la marca es mínima. Lo de inexplicable la verdad es que no es cierto. Y de eso va a ir este artículo: de las armas del Arnidol.

En primer lugar, es bueno saber que Arnidol es una marca resgistrada por los laboratorios Diafarm. Se vende en farmacias y parafarmacias y tan solo especifican en la propia barra que contiene árnica y harpagófito. Pero…¿qué son esos componentes?. A cualquier biólogo le pueden llegar a sonar al mundo vegetal. Y estamos en lo cierto. Escudriñemos en el tema.

Ilustración de la Arnica montana
Ilustración de la Arnica montana. Pulsar para agrandar.

La árnica se asocia a la planta Arnica montana, pero no se puede decir que es una planta ya que si se nombra tal cuál corresponde a la nomenclatura del género correspondiente a 32 especies distintas (esto es un tirón de orejas para los de la web de Arnidol). Estas plantas pertenecen a la misma familia que los girasoles y son escasas por sus requerimientos ecológicas y recolección furtiva. Pero ¿qué tienen estas plantas que las hace tan especiales?. La verdad es que los compuesto que contienen son de lo más variado y útil para su uso en medicina natural. Que no es lo mismo que otras «magufadas». Os dejo el listado de los principales componentes según su localización en la planta (entre paréntesis):

-Ácidos: angélico, fórmico, fumárico, isobutírico, láctico, succínico (rizoma) cafeico, clorogénico, gálico, láurico, málico, esteárico, palmítico (flores).

-Alcaloides: betaína, arnicina ( flores)

-Colina (flor)

-Azúcares: Fructosa (flor) sacarosa raíz)

-Helenalina (flor)

-Dihidrohelenalina (flor)

-Carotenos : Luteolina, xantófila, zeaxantina (flor)

-Taninos catéquicos (raíz)

-Mucílagos (raíz)

-Alcoholes: Faradiol, taraxasterol, Arnidiol, beta-sitosterol (flor)

-Aceite esencial rico en timol.

Podría ir desgranando cada componente, pero me voy a fijar en dos: La helenalina es una lactona sesquiterpénica que tiene como efecto inhibir el factor de transcripción denominado NF-KappaB que está relacionado directamente con la cascada de reacciones celulares que otorga una capacidad antiinflamatoria. El timol es un aceite que tiene propiedades como vasodilatadorde los capilares subcutáneos y así permite el flujo de sangre para que se ayude a restaurar la zona golpeada más rápidamente.

Fotografía del harpagófito o Garra del diablo
Fotografía del harpagófito o Garra del diablo. Pulsar para agrandar.

En cuanto al harpagófito es el nombre común de la especie herbácea y rastrera Harpagophytum procumbens, conocida como Garra del diablo. Posee un principio activo perteneciente a los heterósidos monoterpénicos del tipo irinoide denominado harpagósido. Este compuesto tiene las propiedades antiinflamatorias si se aplica con apósitos en la zona dañada, pero también se ha utilizado de forma oral en tratamiento de la osteoartritis comparando sus efectos con otras medicinas. Con estas propiedades antiinflamatorias, la analgesia es otra de sus virtudes. Aunque se ha descrito como «de forma leve».

Estructura molecular del harpagósido.
Estructura molecular del harpagósido. Pulsar para agrandar.

Por lo tanto y para resumir, la árnica sirve principalmente como antiinflamatorio y vasodilatador y el hapagófito como analgésico y antiinflamatorio. La verdad es que no existen muchos estudios científicos ante estas propiedades de la árnica y el harpagofito, pero algo de soporte científico estudiado en un laboratorio sí que hay. Y os aseguro que también empírico por mi parte. Está indicado para los que hacemos deporte en caso de torceduras y golpes. Pero ni se os ocurra aplicar la barrita cuando haya heridas. Está contraindicado. No seamos zoquetes. Que no es un tres en uno. Y más cuidado hay que tener cuando se trata de los más pequeños de la casa. Mirad esta «anécdota» de una enfermera sobre la magia del Arnidol.
¿Conocíais la existencia de esta barrita mágica?

Esta entrada participa en la XVI edición del Carnaval de Biología, organizado por @moigaren en El Blog Falsable.

Referencias:

Web de Arnidol

G. Lyss, T.J. Schmidt, I. Merfort and H.L. Pahl. 1997. Helenalin, an anti-inflammatory sesquiterpene lactone from Arnica, selectively inhibits transcription factor NF-kappaB. Biol Chem. 378: 951-961.

G. Lyss, A. Knorre, T.J. Schmidt, I. Merfort and H.L. Pahl.The Anti-inflammatory Sesquiterpene Lactone Helenalin Inhibits the Transcription Factor NF-κB by Directly Targeting p65. J. Biol. Chem. 1998 273: 33508-33516.

Devil’s claw (Harpagophytum procumbens DC) MedlinePlus Monograph. Disponible en: URL: http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/druginfo/natural/patient-devilsclaw.html

Chantre P, Cappelaere A, Leblan D, et al. Efficacy and tolerance or Harpagophytum procumbens versus diacerhein in treatment of osteoarthritis. Phytomedicine 2000;7:177-84.

Lecomte A. Harpagophytum dans l’arthrose: Etude en double insu contre placebo. Le Magazine. 1992;15:27-30.

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Dentro de un laboratorio

Estuve dando un garbeo por las galerías de fotos que tenía guardadas sobre todo lo que hice a lo largo de la tesis y me encontré con un vídeo. Se trata de un recuerdo sobre cómo era el laboratorio donde trabajé en Hungría hace cuatro años. El vídeo tiene una pésima calidad, pero es lo máximo que se podía hacer con mi «flamante» Nokia N70 de aquella época. He podido añadir alguna etiqueta para que no sea muy aburrida la visita, pero sin añadir demasiadas, que sólo son 25 segundos. A ver si tengo tiempo y hago más vídeos.

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=z79Xl7SicMg[/youtube]

Escuchando: this WEEK in tech

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Protocolo para geles de Poliacrilamida

Desde hace unos años estoy utilizando protocolos varios para resolver ciertos marcadores moleculares en geles de poliacrilamida. Por falta de tiempo, no he podido nunca poder hacer un vídeo explicativo para que todos vosotros pudierais ver el trabajo que se origina para este tipo de análisis. Pues he encontrado a un grupo de investigadores hindúes, que se han trabajado esos vídeos y me van a permitir mostrar los pasos básicos que se siguen. Os cuelgo dos vídeos que muestran el proceso completo a seguir. Siempre hay variaciones en cada laboratorio, como los equipos a utilizar o las disoluciones, pero en esencia esta bien explicado. Lo más curioso es el inglés-hindú. Me recuerda a Raj, uno de los protagonistas de The Big Bang Theory.
Parte 1.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=qCTc_jTMqJo[/youtube]
Parte 2.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=vfIYE47Ha0E[/youtube]

Espero que sirva de ayuda a alguna mente inquieta. Si tenéis alguna duda, comentádmela.

Escuchando: Gravina 82 episodio 25.

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GEOSTAR: un nuevo laboratorio submarino

Se ha instalado finalmente en el golfo de Cádiz el primer laboratorio submarino para la alerta temprana de tsunamis. Ha sido ubicado en el Golfo de Cádiz, a 60 millas del Cabo de San Vicente y a una profundidad de 3.300 metros. Tiene unas medidas de 5 metros de altura y aproximadamente 2 metros de ancho y profundidad.
El-CSIC-instala-un-laboratorio-submarino-para-la-alerta-temprana-de-tsunamis_mediumEl proyecto de instalación de GEOSTAR comenzó el 7 de noviembre con la colocación de la boya de superficie, asegurada al lecho mediante un cable y un peso. Tres días más tarde, durante la madrugada del 10 al 11 de noviembre, el equipo lanzó el laboratorio desde el Buque Oceanográfico Sarmiento de Gamboa. Estará instalado el tiempo que le duren las baterías de litio que posee (aproximadamente para un año de vida). Después se decidirá si mantenerlo o no. Hasta ese momento estará obteniendo datos de todo tipo para poder estudiar y analizar los movimientos del océano.
Espero que no tenga que bajar un técnico por algún problemilla XDD.

Fuente: CSIC

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Lo maravilloso de las micropipetas


El ajuar de laboratorio es siempre escaso. Y el cansancio que conlleva intentar mejorar esas condiciones es proporcional al material disponible: cuanto más y mejor material se tiene, menos cansancio se acumula. Esto que parece una bobada, cuando se trata de estar haciendo reacciones de PCR durante toda una semana para poder mapear genes…pues deja de ser un simple pipeteo a convertirse en un destroza hombros, antebrazos y pulgares. Y, si además para ver mejor el alicuoteo para cada muestra, el proceso se debe hacer de pie…pues hay que añadir cansancio en las piernas y la espalda. Vamos, que acabas el día como si hubieras trabajado en la obra, con el agotamiento mental añadido de estar concentrado para no pifiarla a la hora de pipetear. Para los que no se hacen una idea: una tanda de PCR normal que realizo yo en el laboratorio consiste en 105 muestras en las que, en cada una de ellas, hay que añadir un volumen determinado de dNTPs, buffer de reacción para la polimerasa, Taq polimerasa, Agua estéril Mili Q y el DNA correspondiente. Todo el mundo científico se vale de la maravillosa ayuda de las casas comerciales que permiten no tener que hacer a mano los búfferes de reacción. Y los dNTPs junto con el búffer y el agua se puede juntar para hacer un mix. Incluso si tienes unos cebadores que vayan bien, puedes incluirlos en el mix. Pero, cuando se trata de mapear genes y tienes que hacer la reacción para cada uno de los 105 individuos para ese gen determinado, pues, al menos, necesitas pipetear…unas 210 veces si haces el mix con primers incluidos y no tienes una micropipeta. A eso hay que añadir los pipeteos de la preparación de los mix de reacción. Todo esto lleva un gasto de tiempo bastante grande. Pero, si se quiere estar seguro de que vaya una concentración determinada de cada pareja de cebadores en cada muestra, pues el número de pipeteos se duplica. Todo esto lo cuento para un científico que no tiene la posibilidad de tener una micropipeta multicanal.
A eso quería yo llegar. Para los que no lo sepan, una pipeta multicanal es, como su nombre indica, una micropipeta que tiene muchos canales. Dependiendo del modelo, las hay de 8 ó 12 canales. Por lo tanto, cada vez que accionamos el émbolo para dejar soltar la alícuota pertinente en una batería de muestras, haremos el mismo trabajo reducido en una octava parte como poco. Vamos, que se puede hacer lo mismo que con la micropipeta normal pero 8 veces más rápido (si tiene ocho canales) ó 12 veces más rápido, como es el caso de la micropipeta que dispongo.
A eso de la reducción de esfuerzo hay que añadir una reducción de error de pipeteo, ya que cada vez que se acciona el mecanismo la succión y vertido es el mismo en los 12 pocillos a la vez.
Pero hay algo más. El cansancio mental también se reduce puesto que no se tiene que estar tan concentrado (esto no significa que no haya que estarlo para que todo vaya bien, eh!) a la hora de controlar los pipeteos.
Si a esto sumamos la pericia de cada investigador a la hora de hacer mixes, la reducción del número de pipeteos se reduce hasta un número de…¡¡36 pipeteos por cada tanda de 105 reacciones!!.
Todo esto también tiene un fallo: la captura de cada punta con las micropipetas multicanal. Cada casa comercial que fabrique este tipo de pipetas, produce unas puntas específicas que permite un mejor anclaje de éstas. Sin embargo, en la gran mayoría de los laboratorios se piden puntas a granel para todas la pipetas y pedir un cargamento a mayores de esas puntas tan específicas conlleva un gasto bastante grande. Siempre que se usan puntas no especiales, se suele tener que apretar un poco cada punta para que tome el volumen correcto. Esto hay que hacerlo con cuidado para preservar las condiciones de esterilidad. Pero cuando ya lo has hecho unas cuantas veces, la maña bate por goleada a la falta de presupuesto.
En fin, que todo laboratorio que tenga que manejar un número considerable de muestras, debería tener unas cuantas micropipetas multicanal. Tan sólo un consejo más: cada pipeta debería ser personal en intransferible. Para evitar continuas descalibraciones.

Escuchando: El golpeo a las teclas del portátil

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