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BioLinux 6.0


Este artículo lo escribo con cierta rabia e indignación, por debajo de la alegría de encontrar algo tan útil como este sistema operativo. Lo comento así porque llevo interesado en mejorar el estado de la bioinformática en este país (donde no hay una carrera o especialización como debería), ya que todos los estudios genéticos necesitan un soporte informático ya sea por un análisis de datos o por un estudio estadístico. Es como si los biólogos tuvieran miedo de meterse en la bioinformática. Pero lo curioso es que, en un congreso al que asistí este pasado verano, hablando distendidamente con grandes cargos de la sociedad española de genética ellos estaban también preocupados por el tema y discutimos la situación de este campo en España. La verdad es que somos pocos los biólogos que nos gusta trastear con los ordenadores y sacarles el máximo partido sin mandarles al carajo, pero la conclusión a la que llegamos es que deberían ser Biólogos y no informáticos los que desarrollaran una especialización en esta materia para poder adecuar mejor los datos a la realidad. Después de esta pequeña pataleta, el motivo de la entrada es mi “descubrimiento” de la nueva versión del sistema operativo Biolinux: la 6.0.
Esta distribución de Linux está basada en Ubuntu 10.04 y la desarrollaron para un público que necesita el uso de herramientas bioinformáticas para sus respectivos proyectos. El grupo que lo ha llevado a cabo es NERC Environmental Bioinformatics Centre y, para no tener que instalarlo de cero en usuarios que ya tengan Ubuntu en su ordenador, han posibilitado la instalación de todos los paquetes necesarios para que se transforme en BioLinux en cuanto a las aplicaciones se refiere. Esto es de gran ayuda puesto que muchos tenemos alojados en algún equipo ese sistema operativo y reinstalar de cero no es de mucho agrado.

La única desventaja es que toda la documentación al respecto está en inglés, pero es algo asumible y que viene siendo habitual. Así se tienen aplicaciones instaladas como el QTLcartographer o CLCsequence viewer, que sirven para mapeo genético y manejo de secuencias. Así también, está adaptado para búsquedas para análisis como Blast. De todas formas AQUÍ está un listado con los paquetes instalados de serie con su descripción.
Siempre que hablo con biólogos que no usan más que güindous sobre sistemas Linux, son un poco esquivos a la hora de instalarlos. No tenéis que instalar el sistema operativo para probarlo con todas las funcionalidades. Estas distribuciones Linux vienen en modo Live, que significa que tan sólo tendréis que iniciar el ordenador (ya sea Mac o PC) para que arranque en el CD ó DVD donde se encuentre la distribución y podréis comprobar la potencia de este software libre.

Sistema Hackintosh

Este fin de semana pasado amplié un poco la capacidad de mi PC de sobremesa (más me gustaría poder comprar un Mac) y se me ocurrió la idea de mejorar el sistema hackintosh que ya tenía instalado. En el post sobre la instalación de leopard en PC que hice hace año y medio ya explicaba como hice, empíricamente, el proceso. Ahora tenía la intención de instalar en un sólo disco SATA de 500Gb Leopard (versión 10.5.7), Ubuntu (versión 9.04) y Windows XP (versíon Profesional con SP2). Intenté seguir los pasos que daban en la web de iAtkos. Pero con varios intentos no pude. Lo del arranque a mi sistema no le gustaba. Así que procedí a instalarlo con otro disco PATA que tenía de 80Gb. De esta forma, instalé (juer con la redundancia de la palabrita) primero Windows XP (editando aquí las particiones que quería. En mi caso creé 4 particiones: una para windows, otra para ubuntu y otras dos para ediciones de vídeo y almacén de archivos en formatos NTFS y Fat32) y Ubuntu en el disco SATA. Cuando acabó todo, me puse a instalar Leopard en el disco PATA. Generé, con la utilidad de Discos en la propia instalación, 2 particiones: una para Leopard y otra para meter cosas de mi investigación. Cuando terminó la instalación, el arranque para Leopard se había escrito en el mbr de ese disco PATA. Lo mejor de todo, es que Chamaleon V2 (que así se llama el gestor de arranque) adquiere todos los arranques que se han instalado en el ordenador. Así que sólo hay que configurar como disco de arranque ese en el que tengo Leopard y puedo iniciar el resto de sistemas operativos.
Una cosa importante a la hora de instalar Leopard es dar a la opción “customize” justo antes de empezar a instalar. Hay que activar cada driver que te convenga. Pero haciendo hincapié en el controlador PS/2, porque si no te quedas sin ratón y teclado (otra cosa es que tus dispositivos sean USB, pero aún así revisa los drivers USB por si acaso).
Todo quedó perfecto. Si teneís alguna duda o pregunta, comentádmela.

Vídeo tutorial de triple boot en Mac

Después de infinidad de pruebas el año pasado para tener instalados (de forma nativa) los 3 sistemas operativos más utilizados, todo se fue al traste y me tuve que conformar con la instalación “normal” mediante boot camp de Leopard y Windows XP,para luego instalar mediante máquina virtual la distro Ubuntu. Pero la esperanza nunca se pierde y, al fin, un buen internauta ha podido explicar de forma perfecta y en un extenso tutorial cómo se hace ese triple arranque. Aquí os dejo el link del vídeo. Tan sólo queda agradecer el trabajo realizado a TaZZiTo.

Triple Boot por Vizu from TaZZiTo on Vimeo.