La secuenciación del genoma del melón es uno de los proyectos más ambiciosos de los grupos de investigación financiado por Genoma España. Ya se tiene un borrador de todo el genoma que tiene un tamaño aproximado de 450 millones de pares de bases en sus 12 cromosomas, con un total de 26.000 genes. Además de la secuenciación de una línea de melón, MELONOMICS pretende caracterizar un gran número de variedades de esta especie presentes en los bancos de semillas españoles.
En diversos congresos a los que he asistido, se mostraron resultados previos de estos estudios y eran más que prometedores. No olvidemos que el melón tienen un gran valor económico ya que somos los primeros exportadores de este fruto.
Se están abriendo nuevos campos en el estudio del cáncer. La universidad de Santiago de Compostela y gracias al grupo liderado por Anxo Vidal Figueroa, ha estudiado esta proteína. La tomorregulina (Tmeff2), una proteína transmembrana que es segregada como hormona, encuentra disminuida su expresión en diferentes tipos tumorales, como el cáncer colorrectal, uno de los que provoca mayor mortalidad después del cáncer de pulmón. Se descubrió que la proteína se vuelve inactiva en los estadios iniciales del cáncer.
Por ahora el estudio se encuentra en análisis preclínicos observando la acción de la sobreexpresión del gen en ratones transgénicos.
Gracias a la gran red de internet he podido encontrar un screencast sobre cómo utilizar esta novedosa opción de twitter: las listas. De esta forma podremos seguir de forma ordenada a las noticias y/o blogs sobre ciencia u otros temas y ampliar también el intercambio de la información de esos tweets.
Cada vez que se produce el lanzamiento de un nuevo móvil se pueden ver mejoras de todo tipo: la cámara con autofocus y flash, pantallas táctiles enormes, mayor resolución, mayor conectividad…¿y la videollamada?. Fue un boom hace un par de años la realización de llamadas de vídeo. Incluso las compañías no hacían más que regalar minutos para cazar más clientes. Pero está llegando a su fin. Todos los nuevos teléfonos móviles que se lanzan (como los iPhone, Android, Xperia…etc.) carecen de esa pequeña cámara anterior de baja resolución. La verdad es que era un método gracioso. Pero más por la novedad que por la utilidad. Ahora ya se pueden conectar muchos teléfonos como webcam mediante la cámara de fotos. Además, con las redes sociales es más rápido colgar una foto o un vídeo en nuestros perfiles y que lo vean de una vez todos los amigos, que llamar a algún contacto y hacer de reportero.
Escuchando: Especial EBE podcast Sevilla de La Buhardilla 2.0
Lo más habitual en cualquier laboratorio de genética es extraer el ADN de cualquier tejido o superficie. En mi caso he podido extraer ADN de hojas de plantas, de semillas, de tejido de lagarto, de lodo, de sangre…e incluso de los compuestos obtenidos de un tanque de fermentación.
Hace unos años era necesario preparar para cada ocasión una serie de tampones o buffers para poder extraer el material hereditario. Y cada disolución tenía que prepararla cada uno. Ahora todo es muy sencillo. Existen kits de extracción para cada tipo de tejido o muestra a analizar. La utilización de estos kits tienen sus pros y sus contras: generalmente la eficiencia de la extracción (la cantidad de ADN obtenido por extracción) suele ser bastante mayor con los métodos tradicionales. Sin embargo, la pureza del ADN aislado es mayor cuando se usan los kits. Dependiendo para qué se vaya a utilizar el ADN y el tipo de estudio, será mejor tener más ADN y menos puro ó viceversa. Las nuevas tecnologías suelen «funcionar» mejor cuanto más limpia sea la extracción, ya que en muchas ocasiones recomiendan purificarlo.kit de extracción de ADN
A modo informativo y dependiendo de la muestra, el tiempo para extraer ADN oscila entre 30 minutos y una hora. Cuantas más muestras se tengan a extraer a la vez, mayor será el tiempo.
Cuando ya se tiene el vial con el ADN disuelto en el tampón de elución, siempre hay que hacer una cuantificación. Con aparatos como el NanoDrop, la cantidad de ADN utilizado para cuantificar es de tan sólo 1 microlitro. Para hacerse una idea, es poco más de lo que ocupa la impresión del punto en el teclado de un ordenador. Hay ocasiones en que existen problemas con las mediciones y se opta por seguir el método tradicional que consiste en hacer un gel de agarosa a una concentración del 0,8% y realizar una electroforesis de todas las extracciones. Posteriormente, la imagen que se obtiene en el transiluminador de rayos ultravioleta (siempre que se utilicen marcajes como el bromuro de etidio o SybrGreen) se utiliza para hacer un cálculo estimado de la concentración de ADN gracias a la extrapolación que nos permite el marcador de fragmentos de ADN (un marcador de ADN en escalera (DNA ladder) no es más que un fragmento de ADN el cuál ha sido cortado de forma que se obtienen bandas de un tamaño conocido), ya que sí que sabremos la concentración cargada en el gel de ese marcador.ejemplo de gel de electroforesis en gel de agarosa. Las concentraciones de las muestras se observan en microgramos/microlitro
Bueno, aquí he dejado unas nociones básicas de una de las primeras partes del trabajo en un laboratorio de Genética. Espero que os haya gustado.
Sí, ha cambiado el título de «bitch» a «chick». Pero da lo mismo. Siendo sábado por la noche…y recordando las noches ibicencas…mejor ved el vídeo y ya está ;-P.
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Buenas noticias para la ciencia española. Hay un intento de fomentar la investigación y dar a conocer la biotecnología entre los estudiantes de la ESO. Sucederá en Sevilla y Valencia entre los meses de Noviembre y Diciembre. Es una iniciativa del grupo «Biotechnofarm». Aunque no se tenga un presupuesto para generar riqueza científica, por lo menos hay gente que intenta promover este mundo en el que la paciencia se está acabando.
La gente se está dando cuenta. Recientemente han cruzado el gran charco hacia el mundo Apple 4 personas cercanas a mí. Sólo hacía falta que vieran lo que era capaz un simple Macbook. Me enorgullece ver que la gente mejora su «batalla» con los ordenadores. Lo que sí que me he dado es que las personas que verdaderamente les gusta el mundillo de los ordenadores e internet sienten un alivio con estas máquinas. Siempre ocurre lo mismo. Excepto los que son algo «agarradillos», que los comprendo porque en estos tiempos la pela manda, que siguen mirando de reojo las características de los portátiles y sobremesas PC.
Sin embargo es interesante dar a conocer que la gran mayoría de los usuarios de ordenadores los utilizan para navegar por la red, leer el correo y escribir documentos o visionar pauerpoins. Por eso con un simple PC les vale. Pero, ¿porqué sigue creciendo el número de switchers?. Muy simple. En primer lugar, un Macbook como el actual valía casi 600€ más que ahora. La demanda de los clientes y el crecimiento de la compañía de la manzanita permite la bajada de precios mejorando la calidad. Lo segundo, que estas máquinas están fabricadas para mejorar una cosa: la productividad. Lo siento mucho, pero si lo que se quiere es avanzar en el trabajo…no hay color. Y yo no me dedico a la informática (aunque es un gran hobby y la biología tiene una rama computerizada en la cuál me muevo mucho por obligación y devoción).
Y no nos engañemos con el «fantástico» Windows 7. Me parece muy bien que la gente esté ilusionada como si fuera el Mesías que los salvara del dictador Vista. Querría saber si dentro de 2 años podré manejar 14 programas a la vez sin problemas de «registros» y encima correr el MapMaker EXP/3.0 (para los que no lo sepan, es un programa MS-DOS de mapeo genético) comiendo el 70% del procesador. Cosa que ahora puedo hacer con mi Macbook de hace 2 años.
Los anuncios de Apple sobre la competencia PC vs. Mac han sido una gran referencia publicitaria y de humor en todo el mundo. No tienen desperdicio. Si eres maquero o switcher (¡enhorabuena!), pasarás un muy buen rato. Aquí os dejo uno para abrir boca:
La metástasis es la causa de muerte en enfermos de cáncer en un 90% de los casos. Un estudio realizado en el MIT de Estados Unidos, ha demostrado que el microRNA miR-31 tiene mucha influencia en la metástasis.
Gran campo el de los microRNAs.
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Ya se tiene un borrador de todo el genoma que tiene un tamaño aproximado de 450 millones de pares de bases en sus 12 cromosomas, con un total de 26.000 genes. Además de la secuenciación de una línea de melón, MELONOMICS pretende caracterizar un gran número de variedades de esta especie presentes en los bancos de semillas españoles.
