XXXII Congreso de la Sociedad Española de Farmacología

Este año este congreso se celebra en León, así que hay que hacer un poco de promoción. Se celebrará los días 15, 16 y 17 de septiembre en las instalaciones del «Edificio El Albéitar» (situado en la Avenida de la Facultad de Veterinaria nº 25). La web creada para el acontecimiento está muy bien elaborada. Incluso tiene la opción de ver un vídeo para dar un paseo por León para la gente que venga de fuera.
Es la primera vez que esta ciudad acoje esta reunión anual de farmacólogos así que el entusiasmo de los organizadores es un buen handicap, por lo que animo a cualquiera que quiera observar los verdaderos avances en farmacología se pase por allí. Por cierto, hay un estudio pionero en farmacocinética sobre un modelo in vitro de una ubre ovina perfundida que permite estudiar la distribución tisular de un fármaco a nivel de la glándula mamaria contribuyendo a completar los estudios farmacocinéticos ya existentes in vivo. Doy fe que es alucinante ver colgada una ubre (sólo la ubre) de un soporte metálico y que siga viva (fisiológicamente hablando).

Escuchando: Desde el matadero, el podcast

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El Alzheimer en las redes sociales

Para empezar, quería exponer la situación de esta enfermedad tal cual lo explican en Alzheimer Universal, centro de este artículo:

«La enfermedad de Alzheimer (EA) es una enfermedad degenerativa de las neuronas de caracter progresivo, de origen todavía desconocido, y frenta a la que no se puede, actualmente, ofrecer ningún tratamiento capaz de curarla o de prevenirla. Es la más frecuente de las demencias, la segunda causa de muerte en población de 65 años y más, y la primera causa de dependencia.
Afecta al 5-7% de la población de más de 65 años (cerca de 800.000 personas en nuestro país)y casi al 25% de los mayores de ochenta y cinco años, es decir, a esta edad, afecta a una de cada cuatro personas.
El número de personas afectadas se duplicará hacia el 2020, debido al envejecimiento continuo de la población, lo que convierte a esta enfermedad en uno de los problemas de salud más graves al que se enfrenta la Sociedad.
Esta enfermedad se manifiesta por perturbaciones progresivas de todas las funciones cognitivas aprendizaje, juicio, pensamiento, etc., El lenguaje, la coordinación de los gestos y las actividades diarias se hacen cada vez más difíciles hasta llegar a la incapacidad absoluta.
Entre el 85% y 90% de las personas afectadas vivien con sus familias, que llevan el peso físico, psicológico y económico al cuidarlas.»

La verdad es que alguna de las causas sí que se conocen, pero no voy a entrar en temas moleculares en esta ocasión. El verdadero problema de la enfermedad es que, y tan sólo en España, están afectadas alrededor de 2 millones y medio de personas. En éste cálculo se incluyen tanto los enfermos como los cuidadores. Y para mejorar la vida de todas esas personas se ha formado una agrupación llamada «Alzheimer Universal» que ha tenido la idea de compartir temas relacionados con ayudar a todo lo que rodea a esta enfermedad. Lo mejor es que son consejos prácticos para sobrellevar este gran problema. Además, se han servido de las redes sociales para abarcar más público y ya son casi 6000 las personas que apoyan la iniciativa en Facebook. También se encuetran en Twitter y tienen un canal de Youtube donde recopilan videos sobre esta enfermedad neurodegenerativa. Os dejo todos los enlaces para acceder a continuación. Iniciativas como estas hacen que sirvan verdaderamente para algo las redes sociales, no sólo como un parque de juegos y distracción.

WEb de Alzheimer universal
Twitter de Alzheimer universal
Facebook de Alzheimer universal
Canal de Youtube de Alzheimer universal

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Incrédulos 006 – De consultorios y burbujas de aire milagroso

Qué gran vuelta la de Zigaurre (para seguirlo en Twitter @zigaurre) a la hora de retomar el podcast de Incrédulos. Tenía que ponerlo en este blog de laboratorio. Tanto por la temática científica como la buena investigación llevada a cabo.
Este episodio trata de uno de los «misterios» en la mejora del rendimiento deportivo: las burbujas de oxígeno. No quiero hacer una sinopsis del programa, pero todo comienza con la adquisición de una Burbuja de oxígeno por el Athletic Club de Bilbao (equipo de fútbol de la Liga BBVA (Primera División Española)) para mejorar el rendimiento de sus jugadores. Por lo menos han conseguido una victoria tras el primer partido de liga. Aunque me parece a mí que la burbuja no ha tenido demasiado que ver, jeje.
En su blog tendréis las referencias tratadas en el podcast. Os dejo a continuación el enlace del episodio para bajároslo o escucharlo directamente en el navegador. Recordad que tenéis la posibilidad de suscribiros al podcast tanto por mi sección de podcasting como en el blog de Incrédulos.
Creo que después de esto quedan muy claras varias cosas que no tuve tiempo de investigar. Chapeau por Zigaurre.

Enlace al Episodio 6 de Incrédulos

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Practicando con la química aislando la cocaína

Aunque sea tabú para muchos, he podido leer en un gran blog como es el de Apuntes científicos desde el MIT la ciencia que hay detrás de la obtención de cocaína. Marca el protocolo a seguir si se quiere obtener 1Kg de cocaína a partir de unos 100Kg de hojas de coca. Muy interesante, sobre todo desde el punto de vista químico. Os lo dejo a continuación a modo de cita:

De la hoja de coca a la cocaína
Si como hacen algunos poblados indígenas las secas y metes en tu boca junto con una bola de fragmentos calcáreos de caracola de mar quemada y triturada, poco a poco irás extrayendo e incorporando a tu organismo un alcaloide llamado cocaína que eliminará tu sensación de hambre, sed, cansancio, dolores, y te mantendrá estimulado durante todo el día.
Pero también puedes recordar las clases de química de productos naturales (disciplina que busca identificar y extraer de la naturaleza sustancias con aplicaciones industriales, agroalimentarias, farmacológicas…) y llevar a cabo un proceso de extracción química ligeramente más elaborado:
Recolectas 100 Kg de hojas de coca (necesitarás unas 6000 plantas) y te pasas media hora triturándolas.
Luego añades 100 Kg de cal (óxido de calcio) y 200 Kg de sal común, y vas pisoteándolas durante una hora para ir rompiendo las paredes de las células vegetales y dejar libres las moléculas de cocaína.
Tu objetivo químico entonces será separar dichas moléculas de todo el resto de componentes en esos grumos sucios de color verde oscuro. En química existen gran cantidad de técnicas de separación, pero una de las más utilizadas – especialmente en los laboratorios de productos naturales- es jugar con la polaridad de las moléculas y su afinidad relativa en ciertos solventes: ir añadiendo diferentes tipos de líquidos que disuelven unas sustancias y no otras, y quedándote en cada caso la fracción que te interese.
Por ejemplo, disolventes orgánicos como la gasolina lo disuelven casi todo: introduces tu mezcla de hojas de coca, cal y sal en un bidón con 120 litros de gasolina, lo remueves durante dos horas, lo filtras, y ya puedes tirar los restos sólidos a la basura. Los componentes de la futura pasta de coca -junto con muchas otras sustancias- se habrán quedado en la fase líquida.
Pero tú no quieres la gasolina para nada. Le añades 10 litros de agua con 50 miligramos de ácido sulfúrico concentrado, remueves enérgicamente durante 10 minutos para que todas las moléculas de la mezcla entren en contacto entre sí, y lo dejas reposar hasta que la fase acuosa y orgánica se separen debido a su diferente densidad. Estás haciendo una clásica decantación líquido-líquido.
Conoces la polaridad de las moléculas de cocaína, y sabes que son mucho más afines a la mayor polaridad de la pequeña fase acuosa que queda en el fondo del recipiente. Coges un tubito, sitúas un extremo en el fondo, y succionas para traspasar a otro recipiente la mezcla transparente de agua, ácido, pasta de coca, sales, y todavía muchas otras sustancias. Eso hay que limpiarlo.
Para ello vas añadiendo poco a poco 1 kg de permanganato potásico. Este compuesto neutralizará los restos de gasolina, cal y sal, y hará que se formen unos grumos sólidos de color marrón oscuro.
Los filtrarás, y te quedarás de nuevo con el líquido transparente que irá goteando dentro de otro recipiente.
Allí es donde se encuentra la mayor parte del alcaloide, disuelto gracias a que el pH es todavía considerablemente ácido.
Entonces vuelves a jugar con las polaridades de las moléculas y su solubilidad: Vas añadiendo poco a poco sosa cáustica para ir neutralizando la acidez de la mezcla y disminuir su polaridad, hasta que una sustancia blanquecina empiece a precipitar.
La filtras. Esa pasta contiene un 90% de cocaína.
Si coges un poquito con el dedo y te la colocas sobre las encías, se anestesiará la zona dejando la misma sensación extraña que cuando el dentista te duerme un área de tu boca.
Lo dejarás secar, y si el proceso ha funcionado correctamente tendrás 1 Kg de pasta de coca lista para ser vendida a narcotraficantes. A ellos sólo les quedará el paso de añadir acetona para limpiar las impurezas de químicos y dejar la cocaína en un estado de polvo ya preparado para su adulteración y posterior uso.

Curiosa la forma de aislar el alcaloide ¿verdad?. Espero que os haya gustado.

Enlace al artículo original

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Los test de ADN directos al consumidor

Dilema de los test genéticos DTCAsí es como se denominan las pruebas genéticas que se pueden contratar para obtener información acerca de enfermedades de tipo hereditario. Si queréis ver alguna empresa que se dedica a estos negocios en el territorio español, os remito a la multitud de publicidad que rota por el blog. Sin embargo, quería dejar de un lado el negocio en sí y comentar sobre lo que verdaderamente proporcionan dichas pruebas DTC (direct to consumer). Esta semana se ha abierto un debate en numerosos blogs y redes como twitter sobre si merece la pena o no hacer las pruebas o si la información que ofrecen con los test es suficiente.
Lo primero que se tiene que dejar claro es que los factores genéticos no siempre son determinantes ante cierto tipo de enfermedades. Siempre se debe tener un seguimiento médico. Hay muchos factores distintos de los genéticos que hay que tener en cuenta. De sobra son conocidos las predisposiciones genéticas de determinadas etnias a trastornos genéticos como la anemia falciforme, por ejemplo. Los hábitos de vida y el ambiente pueden también «moldear» la aparición de la enfermedad hereditaria.
Pero lo curioso es cómo se debe manejar esa información. Una de las mayores empresas norteamericanas que se dedican a estas pruebas genéticas DTC, 23andMe (poseen pruebas para las mutaciones asociadas a fibrosis quística, enfermedad de Tay-Sachs, anemia de células falciformes, y muchas otras condiciones. Si tenéis un Android, podréis jugar un poco con la aplicación que comenté hace unos días.), dice que sabiendo que un niño tiene la oportunidad de nacer con una de estas enfermedades se puede facilitar la intervención temprana y mejorar los resultados. Eso sí, advierten que todos los exámenes de revisión cubren sólo un subconjunto de las posibles mutaciones de cada enfermedad. «Usted todavía podría llevar a una mutación, incluso si los resultados de una compañía de pruebas genéticas DTC dan un resultado negativo» dice Anne Wojcicki, presidenta y cofundadora de 23andMe.
Dependiendo de la compañía suministradora del test, los resultados pueden variar (ver el informe del U.S. Goverment Accountability Office). Muin Khoury, Director de Salud Pública de Genómica para la CDC, dice que: » Si usted está tratando de averiguar su perfil de riesgo para la diabetes tipo II, por ejemplo, alguien podría decirle- «En base a los cinco genes que he analizado, tiene un riesgo mayor que la media de padecer la enfermedad. Pero si se agregan dos genes más, el riesgo podría bajar»-. Mientras que si se sabe la edad de alguien, género, raza, índice de masa corporal e historia familiar, ya se puede predecir con casi el 90 por ciento de certeza si sus hijos recibirán la diabetes tipo II. Y añade: «Asumamos que el informe dice que usted posee un riesgo ligeramente mayor que la media. ¿Se supone que el ejercicio puede disminuir el riesgo? Eso debería hacerse de todos modos. Si el conocimiento del genoma de hoy no me dice nada más de lo que ya sabe la gente, ¿por qué iba a gastar varios cientos de dólares?.

La verdad es que es un tema difícil de tratar. Ya fuera de la ética (dejo la polémica con la película GATTACA), todavía estos test están un paños menores. Y el consejo genético no es algo que se pueda dictar con una simple prueba estándar.
Cómo este tema tiene bastante importancia, se me ha ocurrido publicar una encuesta con una pregunta muy simple para responder ¿Estarías dispuesto/a a realizar una prueba genética DTC (directo al consumidor)?. Os dejo la encuesta AQUÍ para que votéis. Podéis dejar comentarios tanto en este post como en la propia encuesta.

Información interesante para discutir: What DTC Genetic Testing Can—and Can’t—Tell You; DNA dilemma (Newsweek); Informe sobre diferencias de test genéticos entre compañías;

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Nuevos métodos de lucha contra la malaria

Ciclo de vida de la Malaria
Ciclo de vida de la Malaria. Hacer clic para agrandar.
Los investigadores de la Case Western Reserve University, desarrollaron técnicas para identificar rápidamente la evolución de la resistencia a los medicamentos en las cepas de la malaria. Su objetivo es permitir a la comunidad médica reaccionar con rapidez a la resistencia inevitable a dichos fármacos y con ello salvar vidas al tiempo que aumenta la vida útil de los medicamentos utilizados contra la enfermedad.
En la actualidad, seguimiento de la enfermedad requiere meses de ensayos clínicos. Los nuevos métodos pueden proporcionar más información en apenas unos días y de una forma más barata.
Los investigadores han adaptado los ensayos genéticos y el análisis matemático para descubrir y realizar un seguimiento de inmunidad contra la droga de la forma más mortífera de la enfermedad, causada por el parásito Plasmodium falciparum. Pero, la tecnología podría utilizarse para otras formas de la malaria y otras enfermedades.
«Cada año, alrededor de 1 millones a 2,5 millones de niños mueren como resultado directo de la malaria. Una estimación conservadora es que un niño muere de malaria cada 30 segundos», dijo Peter Zimmerman, profesor en la Facultad de Medicina de la Case Western Reserve University. «No hay vacuna para parásitos de la malaria; dependemos de las drogas y la amenaza más grande es que los parásitos siguen evolucionando adquiriendo resistencia a dichos fármacos», dijo Carol Hopkins Sibley, profesora de ciencias del genoma en la Universidad de Washington y director científico de la resistencia mundial contra la malaria.
Se ha realizado un estudio exhaustivo de muestras de sangre de más de 250 individuos de Papua Nueva Guinea infectados de malaria y se han analizado las muestras mediante distinta fluorescencia asignada a los marcadores de la enfermedad y se observaron las mutaciones que padecía el parásito en su genoma que le confería la resistencia a los medicamentos en cada caso.
En un análisis tradicional, las infecciones se representan por la fuerza de la señal fluorescente como puntos en una gráfica cartesiana. El grupo de infecciones sensible a los medicamentos a lo largo del eje x, la resistente a los medicamentos a lo largo del eje Y. Los que tienen ambas infecciones pueden ser en algún punto intermedio y aquellos sin infección se agruparían en los ejes cercanos al cero.
Pero, incluso cuando una desviación estándar fue introducida para dar cuenta de cruce entre las señales fluorescentes, no dieron un trazado limpio de quién se había infectado y con qué.
Drew P. Kourí, matemático que estaba trabajando en el laboratorio de Zimmerman, llevó el problema a Pedro J. Thomas, profesor asistente de matemáticas y biología. Dando vueltas al asunto, descubrieron que podían producir una imagen precisa al posicionar los puntos de datos usando coordenadas polares.
En este método, el eje x es igual a la de fluorescencia para la infección sensible a los medicamentos y el eje y es igual a la fluorescencia para la resistente a los medicamentos. Las 264 muestras de sangre se representan como puntos entre los ejes de acuerdo a la fuerza de la señal. Los resultados: 4 grupos diferentes que reflejan las cuatro posibles diagnósticos. Utilizando el análisis de coordenadas polares, 86 de las 264 muestras fueron reclasificados.
Zimmerman dijo que se necesitan más estudios para verificar que la resistencia a un medicamento específico está asociado con variantes genéticas específicas.
Se podrían buscar fondos para producir un programa de computadora que procesa automáticamente datos usando coordenadas polares: «Si hemos creado una herramienta de análisis de datos basado en la web, podría ser útil para los investigadores de campo sin experiencia matemáticos especializados», dijo el profesor Thomas.
No he querido meterme en las fórmulas y métodos cartesianos que han llevado a los resultados porque tendría que pasarme unos días estudiándolos. Os remito al enlace del estudio, que proporciona el artículo al completo.
Es increíble lo ligados que siempre están los estudios matemáticos y la computación a las ciencias de la vida. Yo sigo sin entender por qué no hay una especialización en ramas como la bioinformática en la carrera de Biología. No una asignatura. Gente como yo, la sacaríamos mucho partido. Y esto es algo que lo hablamos en un congreso de Genética. Pero siempre se queda en eso: habladurías. Espero que os haya gustado.

Más información: BioMed Central Genetics

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Webinars de LI-COR Biosciences

Las vacaciones hacen que nos volvamos perezosos. Y que nos lo pongan todo fácil para seguir la ley del mínimo esfuerzo. Qué mejor que las webinars para estar al tanto de las técnicas que presentan ciertas marcas comerciales. En este caso os LI-COR Biosciences tiene un surtido de webinars que se pueden visionar y compartir con compañeros de trabajo a los que les pueda interesar. Para tener los conceptos claros, un webinar es un seminario virtual al cuál se accede vía web. Son presentaciones con cierta interacción, ya que se pueden hacer preguntas sobre las dudas que surjan a lo largo de las presentaciones.
Imágen de página contenedora de Webinars
En estos webinars, LI-COR Biosciences nos muestra sus tecnologías y cómo sacarles partido. Verdaderamente no son más que presentaciones comerciales, pero pueden dar ideas para avanzar en los diferentes campos de investigación. Os dejo el enlace de la página que contiene el menú de los vídeos. ¡Hala! a hacer clic y ver las películas.

WEBINARS

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AgileMedSearch y Personal Genomics como aplicaciones en potencia

Parece que el mundo de la tecnología móvil y la ciencia comienzan a darse un poco más la mano. Después de la gran aplicación del grupo Mekentosj para iPhone llamada «Papers» para la gestión de artículos y separatas (cuya aplicación para Mac la tengo catalogada como indispensable en mi Macbook), comienzan a abrirse nuevos caminos para sacar partido a «la nube».
AgileMedSearch es una aplicación que permite realizar búsquedas en la base de datos de PubMed y nos muestran los resultados de los estudios relacionados con nuestra búsqueda. De cada estudio sólo se puede leer el resumen o «abstract» y contactar por e-mail con los responsables del artículo, pero algo es algo. Por ahora sólo está disponible para Android. Os dejo el código QR de descarga a continuación.

La aplicación «Personal Genomics» no es más que un programa que sirve para mostrar los estudios realizados por 3 compañías de genómica destinadas a dar servicio de análisis para estudios genéticos. Estas compañías son deCODEme, Navigenics y 23andme. Tan sólo se muestran las referencias de los loci estudiados para 20 enfermedades humanas. Os dejo una imagen de la aplicación tanto para iPhone como Android y el código QR para los «Androides» que la quieran probar.

Aplicación Personal Genomics. Hacer clic para agrandar

Ya sería perfecto si se pudiera elegir entre varias bases de datos distintas dependiendo del estudio que se busque. Pero tiempo al tiempo. Espero que os haya gustado.

Escuchando: Podcast de Soy-friki número 13

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La identidad de los virus intestinales

virus intestinal
Virus intestinal
En un estudio de gemelos idénticos sanos (todas mujeres) y sus madres, los investigadores encontraron que, incluso los gemelos idénticos, portan colecciones de virus distintos en sus intestinos. La investigación se publica hoy 15 de julio en la revista Nature.
A diferencia de los virus que nos enferman, estos virus no son depredadores. De hecho, la mayoría de ellos quieren tener una existencia agradable dentro de las bacterias que viven en el intestino. Aquí, el virus se considera que influye en las actividades de los microbios del sistema digestivo, que entre sus otros beneficios nos permiten digerir ciertos componentes de nuestra dieta, tales como hidratos de carbono de origen vegetal, que no lo podríamos hacer por nuestra cuenta. Además, los virus pueden actuar como un sensor para medir la salud general de la comunidad microbiana intestinal, ya que responden a los estreses y se recuperan después de una enfermedad o intervención terapéutica.
«Los virus son los principales depredadores en el planeta Tierra», dice el autor principal Jeffrey Gordon, director del Centro de la Universidad de Washington para las Ciencias del Genoma y Biología de Sistemas, cuya investigación pionera ha proporcionado una comprensión de la naturaleza de los microbios que viven en nuestro intestino: cómo se adquieren y cómo nos benefician, incluyendo su influencia en la nutrición.
«Gran parte de la información que tenemos acerca de los virus que conviven con las bacterias provienen de estudios de los hábitats del medio ambiente, como los océanos», dice Gordon. «Allí, el estilo de vida de los virus puede ser descrito como una dinámica «depredador-presa», con una batalla continua en la evolución de los cambios genéticos que afectan a los virus y sus huéspedes microbianos. Una batalla que da forma a la estructura y dinámica de las operaciones de estas comunidades microbianas. Queríamos conocer la naturaleza de los virus y su forma de vida en la comunidad microbiana más abundante que habita nuestro cuerpo, la de nuestro intestino.»
En el nuevo estudio, liderado por el estudiante de posgrado y becario Fulbright Alejandro Reyes, los científicos descifraron el ADN aislado de los virus en muestras de heces proporcionados por cuatro parejas de gemelos idénticos y sus madres. Los investigadores secuenciaron el ADN viral a partir de muestras de heces tomadas en tres momentos diferentes durante un período de un año, lo que les permitió seguir cualquier fluctuación en las comunidades virales. Los investigadores también secuenciaron el ADN de todos los microbios de las muestras de heces de las mujeres, que les permitían comparar las comunidades microbianas y virales en el intestino.
Sorprendentemente, más del 80 por ciento de los virus en las muestras de heces no se había descubierto previamente. «La novedad de los virus fue evidente de inmediato», dice Gordon. A cada individuo (por separado) en el estudio, se le asignó una «huella genética» viral correspondiente al análisis de cada uno de los virus encontrados en el intestino grueso. El viriomas (genomas virales) intestinales de los gemelos idénticos eran tan diferentes como el viriomas de individuos no emparentados. Esto contrasta con las bacterias intestinales. Cuando los investigadores observaron a las comunidades de bacterias en las muestras de heces, encontraron que los miembros de la familia compartían, en cierto grado, las mismas especies microbianas.
A pesar de las variaciones distintivas en las comunidades viral de una persona a otra, los investigadores descubrieron que la especie viral predominante en el tracto gastrointestinal inferior de cada individuo se mantuvo estable genéticamente en el período que duró el estudio (un año). Esto difiere de las comunidades bacterianas, que experimentaron mayores fluctuaciones. En otras palabras, los virus de ADN en las muestras de heces no parecían mostrar el estilo de vida «depredador-presa» de las comunidades que se observaban en otros ambientes.
Los investigadores planean ahora estudiar los virus en los intestinos de los gemelos idénticos en desarrollo infantil de diferentes familias para determinar cómo se instalaron inicialmente los virus en el ecosistema intestinal y la forma en que se ven influidas por el estado nutricional de sus huéspedes humanos . Además, para comprender mejor los estilos de vida viral en toda la longitud del intestino, se están introduciendo estos virus en ratones que sólo contienen microbios del intestino humano.
En los últimos años, una serie de proyectos en todo el mundo han iniciado la catalogación de los microbios que viven dentro y en el cuerpo humano, con el objetivo de entender la relación entre las comunidades microbianas, la salud general y la enfermedad. La nueva investigación sugiere que dichos proyectos también deben dirigir su atención a los virus que coexisten y co-evolucionan con las bacterias y otros microbios que normalmente viven en nuestros cuerpos.
Como curiosidad, para la secuenciación del genoma viral utilizaron el sistema de pirosecuenciación Roche 454, obteniéndose un dato total de más de 280 millones de nucleótidos.

Referencia: Revista Nature

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