Nueva cara y aniversario de Cienciaes.com

Ya hace un año que la mejor web dedicada al podcasting sobre divulgación científica diera la luz. La verdad es que deberíamos todos escuchar los podcasts que ofrecen. Más que nada para tener una información de primera mano y nada sensacionalista sobre el mundo científico en varias de sus ramas.
Han mejorado la web. Es más intuitiva y ahora incluye un buscador que hace más fácil las consultas. Además, parece ser que van a ampliar el listado de programas de audio.
Desde aquí les mando mi enhorabuena y os animo a todos vosotros que probéis a escuchar la ciencia. Como siempre, os podréis suscribir desde este mismo blog (ver sección de ciencia en la página de podcasting).

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Movilizaciones en defensa de la Ciencia en España

Esto es un escrito que ha sido difundido por las asociaciones pertenecientes a varias ramas científicas en España. El que os voy a citar fue enviado a todos los socios de la Sociedad Española de Genética (SEG). Aquí os lo dejo. Se permiten todo tipo de comentarios.

«¡MOVILIZACIONES EN DEFENSA DE LA CIENCIA EN ESPAÑA!
La investigación y la innovación son cruciales para el desarrollo y el bienestar de la sociedad, especialmente en tiempos de crisis. En estos momentos se está demostrando que la supuesta prosperidad que daba el ladrillo no era sino pan para ayer y hambre para hoy, y la economía española sigue inmersa en la crisis de la que han salido ya varios países vecinos, que han optado por un modelo económico más sólido.
En este contexto de crisis, tras una década de complacencia, se empezó a hablar con urgencia de la necesidad de un cambio de modelo en pos de una economía sostenible. Sin embargo, observamos, alarmados y con desazón, que la inversión en investigación y desarrollo es el primer «daño colateral» en las finanzas del Estado, a pesar de que sólo dedicamos a Investigación+Desarrollo+innovación (I+D+i) el 1’35% del PIB(1), frente al 2% que se había marcado el PSOE como objetivo para el año 2010(2) o el 3% que fija como meta la Agenda de Lisboa y el Objetivo de Barcelona (3,4,5), cifra que ya es notablemente inferior a la inversión actual de nuestros vecinos del norte de Europa(6).
El daño no se limita al Gobierno central y sus presupuestos, pues la gran mayoría de las Comunidades Autónomas también ha recortado los recursos destinados a investigación o a universidades, en algunos casos en un porcentaje muy elevado. Un colectivo muy afectado por este «tijeretazo» será el de los aspirantes a entrar en la carrera investigadora y, especialmente, el de los científicos con contrato temporal, que verán en muchos casos como éste no se renueva, después de todos sus años de trabajo, durante un proceso de formación y perfeccionamiento continuo financiado en gran parte por el Estado, que desaprovecha así su inversión.
El sector científico fue totalmente marginado de las medidas anticrisis, cuando un Plan-E(7) consagrado a la Investigación y a las infraestructuras científicas podría haber cumplido los mismos objetivos que el efectivamente realizado y haber supuesto un salto cualitativo aprovechable en años posteriores, a diferencia de muchas de las obras que fueron financiadas por el Gobierno central. Del mismo modo, el aumento del paro debería haber impulsado un programa nacional urgente de formación de investigadores y técnicos y de reciclaje de trabajadores de sectores excedentes; además, hubiese sido un excelente momento para impulsar las actividades de I+D+i en el sector privado, especialmente en las PYMES, las más afectadas por la crisis. Oportunidades para conjuntar estímulo y avance de la ciencia y la tecnología no faltan.
Así, en lugar de esforzarse por obtener recursos e idear medidas de estímulo a la I+D+i, ésta ha sido la principal sufridora de la “austeridad”, lo que implicará, necesariamente, que no se puedan cumplir muchas metas. Por detrás de algo que puede sonar tan abstracto como sistema de I+D+i, se esconden cosas tan concretas como la investigación del cambio climático, el descubrimiento de nuevos medicamentos, la optimización energética y el desarrollo de fuentes de energía alternativas, la lucha contra el cáncer, etc. El recorte financiero implicará necesariamente un retraso en estas y otras investigaciones.
Esta amenaza coyuntural, muy preocupante por sí sola, se ve agravada en gran medida porque el sistema científico español adolece de una serie de males estructurales, endémicos, que, en el mejor de los casos, son parcheados de un modo deficiente. Entre estos, podemos señalar:
1. Cambio continuo de los responsables burocráticos y de las estructuras de gestión de la investigación.
2. Falta de un calendario fijo de convocatorias de los diversos programas de ayudas a grupos y proyectos de investigación y atrasos burocráticos en su concesión.
3. Ausencia de continuidad y estabilidad en los programas de Recursos Humanos, con continuos cambios en las fechas de las convocatorias y reiteradas dilaciones en la resolución.
4. Arbitrariedad y falta de planificación en los sistemas de selección, promoción y estabilización, que implican la carencia de una política de RRHH sólida, competitiva y con un proyecto a largo plazo.
5.Paralización de la nueva Ley de la Ciencia y de diversas iniciativas legislativas (EPDI(8), PL-A(9), PL-FJI(10)), necesarias para la regulación de las figuras de las diversas carreras del sistema científico (gestora, docente, técnica e investigadora).
La comunidad científica ha expresado su más firme rechazo ante una situación que es insostenible. Creemos que es necesario mostrar nuestro malestar por esta situación y que es hora de salir a la calle y transmitir un mensaje claro, directo y contundente al Gobierno central, a los diferentes gobiernos autonómicos y a toda la sociedad española.
·Exigimos una apuesta clara y decidida por una sociedad basada en la investigación y el desarrollo como pilares de futuro, mediante un Pacto de Estado por la Ciencia y la Investigación. Exigimos un compromiso real, escrito y a largo plazo de los partidos políticos, con participación de los diferentes agentes sociales implicados y de las Comunidades Autónomas, para dotar de estabilidad y proyección al sistema científico español.
·Exigimos un incremento real (no basado en créditos reembolsables) de los recursos públicos y privados en el sector de I+D+i, de modo que en el plazo más corto posible se iguale la media europea en % de PIB y que se supere esa cifra en un plazo no superior a diez años, de forma que la economía española se convierta en un motor sólido y estable, a la altura de las potencias más desarrolladas. Así mismo, se han de evaluar y revisar, de acuerdo con los resultados o las políticas estratégicas, las subenciones públicas al sector privado de I+D+i.
· Exigimos el diseño de una carrera investigadora basada en la planificación racional de las etapas y en la profesionalización digna de los diferentes estamentos del sistema científico, y que vaya acompañada de una política de recursos humanos rigurosa y coherente que favorezca la estabilización de los investigadores que hayan superado las evaluaciones oportunas y la promoción del personal debidamente examinado y acreditado.
Por todo esto, las diferentes asociaciones, sociedades, sindicatos, grupos e investigadores abajo firmantes creemos que es el momento de que toda la comunidad científica (gestores, docentes, técnicos y científicos) y la sociedad en general se unan en una gran movilización para lanzar un fuerte mensaje al gobierno estatal y a los gobiernos autonómicos: es necesario que todos juntos apostemos clara y decididamente por la ciencia y la innovación en este país.

SALGAMOS TODOS A LA CALLE EL DÍA 6 DE MARZO DE 2010 PARA HACER LLEGAR
ESTE MENSAJE:
«INVESTIGAR ES INVERTIR EN FUTURO»

1 http://www.ine.es/prensa/np575.pdf
2 www.psoe.es/download.do?id=37214 (página 167)
3 http://www.europarl.europa.eu/summits/lis1_es.htm
4 http://cordis.europa.eu/era/3percent_en.html
5 http://europa.eu/rapid/pressReleasesAction.do?reference=IP/02/122&format=HTML&aged=1&language=EN&guiLanguage=en
6 http://epp.eurostat.ec.europa.eu/statistics_explained/index.php/R_&_D_expenditure
7 http://www.plane.gob.es/que-es-el-plan-e/
8 http://www.precarios.org/EPDI-Estatuto+del+Personal+Docente+e+Investigador
9 http://www.precarios.org/Proposicion+de+Ley+Andalucia
10 http://www.precarios.org/Proposici%C3%B3n+de+Ley+FJI
»

A mi lo de echarse a la calle no lo veo muy resolutivo en nuestro caso. Que se pare la ciencia en España no es lo mismo que se paren los servicios o similares. Pero es necesario que se sepa la situación en este país. Difundido está.

Escuchando: El ventilador del procesador trabajando por las secuencias

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Secuenciador SOLiD 4

Life Technologies anunció la semana pasada el lanzamiento de su nuevo secuenciador: el SOLiD 4. Generará un total de 100Gb de datos por análisis y un coste total de 6.000 dólares por genoma (datos que cubren los consumibles pero no la interpretación de los datos ni el mantenimiento de la máquina).
Lo curioso es que, viendo el progresivo avance de los sistemas de secuenciación, Life Technologies piensa lanzar una actualización del sistema a lo largo de este año para triplicar el volumen de datos, pasando a 300Gb y con un coste de 3.000 dólares por secuencia.
Aunque los equipos Illumina (de Roche) son los verdaderos protagonistas a la hora de nuevas adquisiciones por los laboratorios en todo el mundo, es bueno que el resto de las compañías mejoren estos aparatos como Pacific Biosciences y Oxford Nanopore. A finales de este mes se celebrará la undécima edición de la reunión anual de la AGBT (Advances in Genome Biology and Technology)en Marco Island, Florida. Allí se presentarán las nuevas tecnologías de secuenciación por todas las compañías que asistan. No sería mal viaje ir, aunque lo menos que se haga caso fuese el congreso.
Cada vez se abaratan más los costes. Dentro de poco ya no habrá misterios para muchos DNAólogos como yo.

Escuchando: Podcast de Economía for Dummies

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Dieta mediterránea aliada contra el cáncer

Se ha podido demostrar que la dieta mediterránea ayuda a prevenir el cáncer de cólon. El estudio ha incluido 485.044 personas de entre 35 y 70 años procedentes de diez países europeos. Se hizo un seguimiento de los participantes durante cerca de nueve años y se recogieron datos sobre su dieta y estilos de vida.
Todos recibieron una puntuación del 0 al 18 según su adherencia a la dieta mediterránea: elevado consumo de fruta, verduras, cereales, legumbres, frutos secos, pescado y aceite de oliva, moderado consumo de alcohol y bajo consumo de lácteos y carne.
Después de nueve años de seguimiento, 449 personas desarrollaron cáncer gástrico. Según el estudio, los individuos con una mejor puntuación, es decir, con mayor adherencia a la dieta mediterránea, tenían un 33% menos de posibilidades de desarrollar este tipo de tumores que aquéllos con peor puntuación. El trabajo también concluye que cada punto de más, lo que implica unos cambios mínimos en la dieta, confiere un 5% más de protección.
Este proyecto en el que han participado un grupo de científicos del Instituto Catalán de Oncología (ICO) y del Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge (IDIBELL), liderado por Genevieve Buckland y Carlos A. González, se publica en ‘American Journal of Clinical Nutrition’.
Me encanta saber que comer bien en España tiene sus frutos. Por cierto, me rugen las tripas. Voy a practicar un poco de profilaxis.

FUENTE: American Journal of Clinical Nutrition, online 9 de diciembre del 2009.

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Los transtornos compulsivos en los perros y las causas genéticas

En un estudio realizado por el Servicio del Comportamiento y la Escuela Cummings de Medicina Veterinaria, el Programa de Medicina Genética de la Escuela Médica de la Universidad de Massachusetts y el Instituto Broad del Instituto de Tecnología de Massachusetts, se ha detectado la relación directa que confiere un locus determinado del cromosoma 7 con el riesgo a la susceptibilidad de padecer estos trastornos compulsivos.
Se ha comprobado que hay una gran incidencia de esta enfermedad en la cría de las razas Doberman y Bull Terrier. Una de las herramientas que se han utilizado es el genotipado mediante microarrays de la casa Affymetrix. La sobreexpresión del gen de la caderina-2 (CDH2) está relacionada con el flujo del calcio en la actividad sináptica y la adhesión neuronal. Este gen se expresa en el hipocampo, que es una región del cerebro sospechosa de estar involucrada en ese desorden compulsivo. Además, también esa relación de la adhesión neuronal con el gen CDH2 parece afectar a otros desordenes mentales como el autismo.
De esta forma se puede realizar un estudio genético y asesorar en un futuro de la posibilidad de padecer esta enfermedad.

Fuente: Molecular Psychiatry January 2010.

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Hadrones para curar el cáncer

Instalaciones del Gran Colisionador de Hadrones del CERN en Ginebra (Suiza)
Desde que se pudo utilizar la energía de los rayos X para combatir las células cancerígena ha habido el problema de dirigir eficientemente esos rayos contra las células tumorales. Los rayos X pueden originar daños igualmente a las células malignas como a las colindantes que están sanas. Y eso es más peligroso cuando se encuentran cerca de órganos vitales.
La posibilidad de manejar los hadrones (es una partícula subatómica que experimenta la interacción nuclear fuerte. Los neutrones y protones son ejemplos de hadrones) para dirigirlos contra las células mutadas puede ayudar bastante en el tratamiento de diversas enfemedades cancerígenas.
Lo malo de todo esto es el gasto que conlleva: 100 millones de euro es el coste aproximado de una instalación típica. En Europa hay 9 y en Estados Unidos otros 5. Aunque se sabe que en Valencia se está comenzando a desarrollar un grupo de investigación en el que se construiría un colisionador para los estudios del cáncer. Según tengo informado, ya han recibido este tipo de terapia unos 80.000 pacientes en todo el mundo que sufrían, en su mayoría, problemas en los ojos. Sin embargo se tienen unas declaraciones de un paciente mediático en EE.UU.: “No sentí náuseas ni sufrí quemaduras por la radiación, y la terapia duró menos de dos minutos”, dijo Stan Jordan, congresista de Florida, que recibió terapia de protones para un cáncer de próstata avanzado en el Instituto de Prototerapia de la Universidad de Florida, en Shands Jacksonville.
Os podéis descargar este artículo en formato pdf donde explican un poco el desarrollo de esta técnica. Está en inglés, pero es bastante gráfico.
Más fusiones científicas en favor de la vida. Esto me empieza a gustar.

Fuente: Popular Science

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BASTA YA! LOS GENETISTAS NO SON MÉDICOS

Un artículo reciente publicado en el diario (versión digital) «El Mundo» me ha animado a escribir esta entrada en el blog. El mencionado escrito se titula «Genetista, una especialidad en el limbo» la verdad, me ha enervado un poco la malainformación que se genera a partir del mismo. Señores y señoras, estamos en España y lo que sale en la serie «House» no se puede aplicar aquí. Los que estudian la genética y están especializados en la misma se denominan genetistas. Son profesionales en la rama que analiza el material hereditario denominado ADN y todo lo que lo rodea. Y no son médicos, no. Son biólogos pertenecientes a la especialización por la rama fundamental (en la mayoría de los casos).
Desde que he podido asistir a varias reuniones de la Sociedad Española de Genética se ha discutido en conferencias plenarias la inclusión de un departamento exclusivo de Genética en el sistema hospitalario. Porque somos uno de los pocos países que no lo tiene. Pero no importa. Seguimos cegados por la información que generan los medios. Esta tal María Valerio, autora del escrito, no se habrá preocupado ni siquiera en repasarlo. Parece que ha hecho un corta pega. Evidencia que sobresale simplemente al observar cómo termina el artículo. Que la medicina no se haga cargo de arroparse de la gran ayuda que puedan prestar los genetistas no significa que la especialidad esté en el limbo. Menuda desfachatez. A parte de los grandísimos centros dedicados al estudio de enfermedades genéticas en humanos (institutos como el CNIO es un mero ejemplo de ellos), hay genetistas en otras ramas como la biología animal, vegetal o de microorganismos. Y no dejan de ser genetistas.
Después de la explicación, rizaré un poco el rizo. En el artículo se menciona la figura del asesor genético que tienen otros países. Bien. Comparemos figuras laborales. Cuando se va al taller del coche, ¿podemos obtener información detallada de la póliza de nuestro seguro del coche de manos del mecánico? Para que sea más clara la ironía, ¿el agente de seguros nos puede decir qué pieza cambiar del coche porque el motor suena raro? Si estamos hablando de lo mismo, de coches, al fin y al cabo. Hay ramas y estudios que se tienen que especializar aunque tengan nexos de unión. La genética es una y la medicina otra. Pero se pueden complementar a la perfección con una buena coordinación. Y yo, siendo genetista, podré asesorar a un médico y éste realizará un trabajo más eficiente.
Creo que he dejado bastante clara mi opinión. Pero lo más importante es que quede claro que ser GENETISTA no está en el limbo. Que los periodistas se dediquen a informar de una vez y dejen de despistar al público. Un respeto.

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Hablando con científicos: del zumo de limón al E-330. Aditivos alimentarios.

Siempre se está dudando y opinando sobre las etiquetas de los alimentos. Que si los que empiezan con la letra E y ciertos números son muy perjudiciales para la salud, que si cuantos más aditivos peor es el alimento…etc. En este episodio se habla con D. Miguel Calvo Rebollar, perteneciente a la rama de tecnología de los alimentos, que explica uno a uno esos códigos y qué son. Seguro que más de uno se tragará las palabras. Escuchádlo desde el enlace si no os queréis suscribir al podcast, que sólo dura 30 minutos.

Enlace del episodio

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SNPedia: una enciclopedia de los SNPs

Los polimorfismos de un único nucleótido (Single Nucleotide Polimorphism=SNP) son una de las variaciones más estudiadas en todos los genomas y, especialmente, en humanos. Estos SNPs (se lee esnips) no son más que variaciones de una sola base de la secuencia de ADN. Ahora también se consideran SNPs a unos cuantos nucleótidos que varían, como también pequeñas inserciones y deleciones pueden ser consideradas como SNP.

Ejemplo de SNP

Es una de las tareas en las que estoy embarcado en estos momentos y con el avance de las tecnologías cada vez se conoce más y se tienen más datos sobre este tipo de variaciones. Sólo un dato: el 90% de todas las variaciones del genoma humano pertenecen a SNPs. Por lo tanto, son numerosos los estudios que se basan en estos SNPs para detectar enfermedades. Y no sólo en la especie humana.
Quería compartir una base de datos muy importante en este campo: la SNPedia. Consta de un catálogo de los SNPs que se van descubriendo y secuenciando. Incluso están clasificándolos por genomas utilizados, genes involucrados y también medicinas que actúan mejor o peor dependiendo de tener o no estas variaciones.
Os dejo este enlace para la SNPedia y otro para su blog, donde actualmente han publicado los 10 SNPs más relevantes del pasado año. Me encantan estas cosas.

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