Monthly Archives: Febrero 2010

Los científicos chinos no quieren decir adiós a Google

Yo también entiendo a los científicos chinos. Que les bloqueen Google es de las peores cosas que pueden hundir el afán investigador. En China, Baidu sigue siendo el buscador por excelencia acaparando el 60% de las búsquedas. Sin embargo, la dedicación investigadora se mejora muchísimo con todo lo que ofrece Google. No sólo es un rectángulo donde se mete lo que se quiera y seleccionar buscar. No. Google ofrece servicios como Google Scholar, Docs o Reader que facilitan sobremanera las búsquedas bibliográficas, la edición de documentos y el manejo de la información. Estoy con ellos a muerte en sus quejas y declaraciones. Tampoco les viene bien a los gobernantes chinos cerrar esa valla que podría cortar su expansión. Aunque, siendo egoístas, igual nos vendría bien al resto una pausa en su avance.

Preparación de gel de agarosa para electroforesis

Esto parece más de cocinitas, pero es algo básico en un laboratorio de biología molecular. La agarosa es un polisacárido formado por galactosas alfa y beta que se extrae de las algas de los géneros Gellidium y Gracillaria. De lo que se trata es de formar una matriz inerte y no tóxica para construir geles que permitan separar moléculas de ADN mediante electroforesis, además de ser utilizada para fijar moléculas a su estructura como anticuerpos, antígenos y enzimas. Igualmente se utiliza para el cultivo celular y microbiología. Otros usos menos extendidos son la utilización de estos geles como matrices en la reparación de tejidos dañados.
Una vez puestos en materia nos quedamos con la idea principal: separación de moléculas gracias a un entramado que lo permite. Esta separación se produce gracias a la aplicación de un campo eléctrico. Las muestras migrarán de un lado a otro dirigidas por ese campo eléctrico. Así moléculas como los ácidos nucleicos que son de polaridad negativa se dirigirán al ánodo.
Para la preparación de un gel de agarosa se precisan 4 cosas:

La secuenciación puede cambiar un diagnóstico

Vaya vaya. Parece ser que la genética vuelve a revolucionar la medicina. Por primera vez en la historia, un estudio de secuenciación de ADN ha hecho cambiar el diagnóstico de los médicos. Se trata de un caso en Turquía en el que un niño de pocos meses padecía un trastorno que provocaba pérdida de peso y deshidratación. Al principio, los médicos diagnosticaron como causa más probable el síndrome de Bartter. Es un mal que afecta a uno de cada 100000 bebés y causa bajos niveles de potasio y otras sales ocasionando un fallo en el riñón. Menos mal que, para completar el estudio, enviaron muestras de sangre al genetista Richard Lifton del Yale Medical School. De esta forma querían ratificar cuál era el gen causante de la enfermedad. Pero Lifton sospechó de que no era ese síndrome el culpable de la enfermedad del niño y lo que hizo fue secuenciar el genoma del bebé. Esto hubiera sido impensable hace años por los costes, el tiempo y la tecnología a utilizar, pero ahora es otro cantar. Pues menuda sorpresa se llevaron todos al comprobar que el síndrome de Bartter no era la causa sino otro trastorno llamado “congenital chloride diarrhea”, que provoca también bajos niveles de sales.
El caso ha sido publicado en Proceedings of the National Academies of the Sciences (PNAS, para los que estamos muy metidos) el pasado octubre. Para que os hagáis una idea, el coste de descifrar 6 mil millones de bases en el genoma humano a caído de 1 million de dólares en 2007 a menos de 20000 dólares hoy en día. Lifton utilizó un método de extracción de dos pasos y secuenció sólo el 1% de esas bases, que contienen genes conocidos, disminuyendo el coste a 2500 dólares.
Como podéis deducir, una nueva era médica basada en la genética está comenzando a llegar. Antes no se aprobaba el diagnóstico por secuenciación. Ya no sólo por la tecnología, sino por los acuerdos con los seguros médicos.
Realmente, noticias como esta hacen que me guste cada vez más mi profesión.
Fuente: Genetic diagnosis by whole exome capture and massively parallel DNA sequencing

Hablamos con José Rafael Esteban Durán. Nuevo podcast entomológico

Hablando con científicosPara los amantes de la Entomología hay una muy buena noticia: se está montando un nuevo programa dedicado al mundo de los insectos gracias a Cienciaes.com y José Rafael Esteban. La semana pasada salió a la luz una nueva entrega de Hablando con científicos. En esta ocasión se recordó una entrevista realizada a José Rafael Esteban Durán en la que se hablaba de los insectos en general y de un tipo de lepidóptero en particular. Lo mejor de todo es que se comprometieron a ampliar la parrilla de podcast dedicando uno al mundo de los insectos. Escuchadlo y veréis lo apasionante de esta parte de la Zoología.