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Nueva tanda de SSRs

Parece ser que el uso de nuevas tecnologías esta dando efecto. Un grupo en Canadá acaba de analizar más de 36000 (sí sí, más de 36000) secuencias no redundantes procedentes de unas 190000 secuencias iniciales de ESTs de Medicago truncatula. Lo bueno que tiene esto es que el estudio a ido dirigido para analizar la transferencia del uso de estos marcadores a otras especies, ya sean leguminosas o no.

Enlace: Development and characterization of genic SSR markers in Medicago truncatula and their transferability in leguminous and non-leguminous species

Escuchando: Podcast Frikeando.es

A la caza de variación genética

Después de varios años utilizando como marcadores moleculares los desfasados RFLPs, RAPDs y AFLPs, he podido saber de buena tinta que el futuro pasa de largo por los muy utilizados microsatélites (SSRs) y que va directo a los SNPs. Todo esto se debe, claro, a la aplicación que están teniendo estos marcadores en genética humana. Pero, sobre todo, el gran avance se debe a las tecnologías nuevas a la hora de su detección. Los “Next-generation DNA sequencing methods” son los verdaderos culpables del avance científico a la hora de hallar nuevas variaciones en el DNA.
De todas formas, estamos esperando nuevas tecnologías que permitan una secuenciación parecida a la basada en los métodos convencionales de Sanger, pero con mucha más precisión y obteniendo secuencias más grandes que 600 pares de bases (número de bases en los que estos métodos tienen menor número de errores).
La ciencia sigue siendo paciencia en un 95%.