Secuenciación del genoma de la oveja en León

El equipo de León ha sido escogido por su experiencia en la materia en la identificación de determinadas regiones del genoma de la oveja que influyen en la producción de leche. El grupo de investigación de la Universidad trabaja desde los años ’80 en este ámbito.
El equipo de investigadores, denominado Mejora Genética Animal (Mega), está considerado grupo de excelencia por la Junta de Castilla y León. Es el único miembro español de un proyecto que involucra a varios centros de la Unión Europea (Reino Unido, Francia e Italia), EE UU, Australia, Nueva Zelanda, China y Argentina. Esto es, casi todos los países albergan importantes cabañas ovinas y están interesados en la mejora de la producción animal en este ámbito. La iniciativa está financiada con fondos comunitarios. Los científicos pretenden obtener los primeros resultados a partir de 2012.
Se estima que el genoma de la oveja consta de entre 20.000 y 25.000 genes, cifra similar para otros mamíferos y similar al de la especie humana. Aunque no ha determinado su composición total, hay partes del genoma que se conoce por parte de la comunidad científica, ya que es muy similar al de la vaca, ya secuenciado. El trabajo de caracterización de la Universidad de León tendrá como fin último la identificación de estos genes implicados en la producción de leche, para introducir mejoras en la obtención de este alimento.
Olé por la investigación en España. Además que me salpica bien cerquita…a unos metros tan sólo. Me enorgullecen estas iniciativas.

Fuente:DiYCT

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Hablando con científicos: Osos, montañas, proteínas y Nobel de Química 2009.

Hablando con científicosEse es el título del nuevo programa del podcast «Hablando con científicos». Siguiendo con la conmemoración de los premios Nobel 2009, este capítulo va dirigido a los premiados en la categoría de Química. De nuevo se hablará de esa molécula tan importante como es el ácido desoxirribonucleico y que ya os comenté en otro post. Además se incluye la entrevista con Juan Pedro García Ballesta, jefe del equipo de Estructura y Función del Ribosoma en el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, un centro conjunto del Consejo de Investigaciones Científicas de España y la Universidad Autónoma de Madrid.

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Él sobre ella

No seáis malpensados. Voy a comentar algo básico en un laboratorio: el uso de ácidos a la hora de ser diluídos. Hay una regla que me explicaron en primer año de carrera. A las chicas les pareció machista y a nosotros práctico. Como dijo nuestro profesor de Bioquímica : «recordad, siempre él sobre ella». Gran consejo. Cuando se manejan ácidos en el laboratorio, a la hora de mezclar con otros líquidos se genera cierta inestabilidad. Lo más común en los laboratorios es hacer soluciones en las que se mezclan varios líquidos, entre los que están los ácidos. Normalmente las cantidades con las que se manejan no ocasionan peligro. Pero sí que puede llevarse un susto el newbiee de laboratorio. Lo mejor es añadir el ácido al final de todas los solutos (componentes de una disolución), a no ser que se contraindique o que se sepa de antemano que pueda ser más inestable que la opción anterior. Yo puedo hablar desde mi experiencia y casi todos los años surgen dudas sobre ello. La solución: él sobre ella.

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Relaciones genéticas y bioinformática

El grupo de investigación en Minería de Datos y Bioinformática de la Universidad Pablo de Olavide, liderado por el profesor Jesús Aguilar, ha publicado un artículo en la revista Briefings in Bioinformatics sobre el uso de las técnicas de extracción de patrones frecuentes a partir de datos de expresión génica, lo que contribuye a la mejora de la identificación de las relaciones entre genes en procesos biológicos o enfermedades.
El objetivo del estudio es ofrecer a los investigadores en bioinformática, más próximos a las ciencias de la vida, los conceptos y técnicas fundamentales de la minería de datos (técnica que prepara, sondea y explora los datos para extraer el conocimiento oculto en ellos), así como su posible aplicación, en relación con el análisis de patrones frecuentes en datos de expresión génica. En el ámbito humano, el objetivo principal de la minería de datos es saber cómo los cambios en la expresión de los genes de un individuo afectan al riesgo de desarrollar enfermedades comunes (como por ejemplo el cáncer). Esto es muy importante para ayudar a mejorar el diagnóstico, prevención y tratamiento de las enfermedades.

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El cine en 3D en León

Desde el verano pasado y con el estreno de «La edad de hielo 3», se comenzaron a proyectar películas en 3 dimensiones en los cines Van Gogh. Aconsejo que los leoneses vayan a ver una de las películas que estén en cartelera. Los precios son muy baratos en comparación con ciudades como Barcelona (que me costó 10€). Aquí los precios son de 7,90€ los fines de semana y de 7,50€ de lunes a viernes, reduciéndose la tarifa el día del espectador (los miércoles) a 6,50€. Algo bueno nos deja el cine.

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La SGAE contraataca de nuevo

Es curioso ver lo que hace esa “sociedad” para llamar la atención. Los intereses de esos individuos debería ser buscar nuevas vías para promocionar la música y no cortar por lo sano. Este post viene a colación por lo sucedido en la peluquería en la que estaban con la radio puesta. Por favor. Que quieren hacer ahora, ¿ir negocio por negocio en busca de todo lo que tenga derechos de autor? Ya sé que habrá gente que esté leyendo esto y que se sienta aludida. Pero tan sólo pido un poco de sentido común. Para que sea más comprensible, voy a poner un ejemplo que me pilla de lleno. En el mundo en el que trabajo, el uso de dispositivos informáticos es obligado: manejo de archivos, edición de imágenes, búsquedas, almacenamiento…etc. Ya demasiado que estando en una Universidad pública, tengamos que buscarnos la vida a la hora de adquirir licencias de todo tipo (como sistemas operativos, suites de ofimática u otro software destinado al manejo de datos bioinformáticos). Encima los ordenadores, discos duros, memorias usb, CDs y DVDs y demás consumibles llevan ese canon de derechos de autor. Como piensan esa gente que nosotros vamos a utilizar el material destinado a investigación para bajarnos o manejar música o libros u otra cosa con copyright. Eso se hace en casa de cada uno. En vez de capar esas opciones, pues a pagar se ha dicho. Es muy gracioso. En China no les permiten entran en youtube y aquí podemos hacer lo que queramos trabajando para poder llevarse el canon los de la SGAE. Y encima pagando ya por hacer piratería.
Es que me parece muy gracioso. Ahora no vamos a poder poner una radio en el laboratorio para trabajar en un ambiente distendido. Y ¿qué pasa con los conductores profesionales? ¿Tampoco pueden escuchar la radio? Es alucinante. Ya sé que recibiré comentarios de gente de todo tipo. Todos quieren barrer para su casa. Pero tan sólo pido que sigan un sentido común. Yo no quiero que el señor David Bisbal o el señor Alejandro Sanz sigan ganando más en sus mansiones de lujo y tampoco que las nuevas promesas no tengan dinero para comer. Se llama equilibrio. Tan sólo quería desahogarme un poco y compartir opiniones.

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La semana de la Ciencia

Comienza la semana de la Ciencia que se celebra del 9 al 22 de noviembre por octavo año consecutivo en todas las comunidades autónomas. Este 2009 ha sido declarado “Año de Darwin» para conmemorar el bicentenario del nacimiento de Charles Robert Darwin, así como el aniversario de los 150 años de la publicación de su gran obra, “El origen de las especies”. Un motivo más de fiesta. Espero que no sea una ayuda más de esas del ministerio de ciencia e innovación (lo de las minúsculas es a propósito XD).

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El ADN

El ácido desoxirribonucléico ó ADN es una molécula de tipo polímero ya que está compuesta por una cadena de monómeros unidos entre sí. Cada monómero se llama nucleótido, que a su vez está constituído por tres componentes: una base nitrogenada, una pentosa (azúcar de cinco carbonos) y un fosfato.
La base del código genético la dictan las bases nitrogenadas. Son cuatro en el ADN Adenina y Guanina (A y G), que son bases púricas y Citosina y Timina (C y T), que son bases pirimidínicas. En el ARN la Timina deja lugar a la base llamada Uracilo (U). Por lo tanto existen cinco tipos de bases nitrogenadas. La combinación de las bases nitrogenadas provoca la generación del código genético. Por eso se pueden ver que las secuencias de ADN son del tipo «AACTGGGTCATGCGAA».

Estructura molecular del ADN
Estructura molecular del ADN

A forma de repaso, quería recalcar que las bases nitrogenadas se unen a los azúcares (ribosas en el caso del ADN) y dan lugar a nucleósidos. Posteriormente, esos nucleósidos al unirse los fosfatos dan lugar a los nucleótidos. Era para recordar ese anuncio de una crema que anunciaba el descubrimiento de una molécula llamada Adenosina. Es para reirse. Que es la Adenosina más que el nucleósido que tiene la Adenina como base nitrogenada. Pero, qué se le va a hacer. Finalmente, el ADN (se puede extrapolar igualmente al ARN si se recuerda que las Timinas son Uracilos) no es más que la polimerización de nucleótidos que se unen mediante enlaces fosfato. A lo largo de la hebra van quedando los residuos de fosfato, con carga negativa, que confieren el carácter ácido a la molécula.
Hasta ahora se ha hablado de la formación de una hebra de ADN. Pero la forma básica de nuestro material hereditario no se encuentra un una sola hebra. Dos de estas hebras, que son complementarias por las uniones entre las bases púricas y las pirimidínicas (A con T y C con G), forman la doble hélice de ADN. Tiene un tamaño de 20 Armtrongs de diámetro y da una vuelta completa cada 34 Armstrongs.
Doble hélice de ADN
Doble hélice de ADN
Hay otras formas de hélice, pero esta es la forma natural y estable que se encuentra en la mayoría de las células. Posteriormente esta doble hélice sufrirá empaquetamientos sucesivos que daran lugar a su compresión y formación de los distintos cromosomas.
Bueno, espero que haya sido de utilidad. Si tenéis dudas, comentadlas e intentaré aclararlas todas.

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Droidcast

Como bien se escucha nada más empezar el podcast, se trata de un podcast sobre Android y mucho más. Quiero recomendarlo porque me parece muy original. Al comienzo del programa el tema a tratar es el sistema operativo Android, sobre las aplicaciones, teléfonos y todo lo que puede ofrecer ese software de Google.
Pero luego comienza una segunda parte donde los temas son libres. Se puede oir desde Bonsais a fotografía, de seguridad en la red a podcasting en general. Incluso opinar sobre programas de televisión o sobre la forma en la que se está llevando la política de empleo.
Sencillamente genial. Llevo muchos podcast a la espalda y este engancha sobremanera. Podéis suscribiros en la sección de podcasting del blog.

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