Novedades en las búsquedas BLAST

Hace unos días me llegó la noticia de que la herramienta dedicada a las búsquedas BLAST en el NCBI se había actualizado ofreciendo novedades.
Al obtener los resultados aparece en la parte superior un enlace a un nuevo tipo de informe «View these results in the new enhanced report» junto otro enlace a un video de YouTube donde se detallan las nuevas opciones.

Entre ellas cabe destacar por su utilidad, la posibilidad de descargar únicamente las regiones de las secuencias de la base de datos que alinean con la nuestra, así como ver gráficamente alineamientos múltiples. Os animo a ver dicho vídeo explicativo de tres minutos:

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=yfITRIk34Js[/youtube]

Doy las gracias al Dr. Carlos Polanco del área de Genética de la Universidad de León por seguir enviando esos correos que ayudan a estar al día de estas pequeñas grandes cosas.

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Jugando a alinear secuencias con Phylo

Logo de Phylo
Ya era hora de que saliera un jueguecito para los que analizamos secuencias. Se trata de Phylo (su nombre completo es ‘Phylo: A Human Computing Framework for Comparative Genomics’), que es un juego creado en flash (sí, como esos juegos en los que se cuidan animales y tal ;-D) consistente en alineamientos de secuencias. Trata de enseñar cómo alinear secuencias gracias a unas cajitas de colores que sustituyen los valores reales de ADN, ARN y proteínas (nucleótidos y aminoácidos para ser más exactos). El alineamiento que puede tocar puede ser por lo tanto tanto secuencias de ADN como de ARN como proteínicas. Para iniciarse en esto de los alineamientos y comprender un poco el «tema» no está mal. Tiene varios niveles y se juegan con especies más o menos emparentadas que generarán alineamientos más o menos complejos. También aumenta la dificultad con un temporizador para cada alineamiento.

Ejemplo del juego Phylo
Ejemplo del juego Phylo

El juego-puzzle ha sido desarrollado por el Departamento de Bioinformática de la Universidad McGill de Canadá. Se puede jugar contra la CPU o contra otros jugadores (previo registro) e incluso tus resultados pueden ser enviados a la Universidad de California para que puedan ser cotejados por ellos. Según dicen, esas secuencias del juego son ejemplos reales y que pueden servir los alineamientos conseguidos para avanzar en investigaciones basadas en análisis de secuencias.

Tendría que dedicar unos cuantos artículos para poder explicar claramente cómo se alinean secuencias y todos los programas que se pueden usar y las variables para que el alineamiento sea más efectivo. Pero no está mal juguetear un poco para sacar las primeras impresiones. Y tranquilos, seguro que más de uno se vuelve un poco loco.

Enlace al juego

Escuchando: Los Danko

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Batidos caseros para ganar músculo

Batidos de proteínas

La ingesta de proteínas es clave para el desarrollo muscular. Más aún si se exige mucho a los músculos como en el entrenamiento de gimnasio. Reponer el tejido es clave y el aporte de proteínas permite esa regeneración tisular. Dejo esta lista de batidos caseros que añadirán un aporte proteico extra en la dieta. Sobre todo es una alternativa muy recomendable a los polvitos de proteínas.

-Batido de 1 vaso de yogur líquido con 1 clara de huevo cocida.

-Batido de gelatina de fresas con fresas y 1 vaso de leche desnatada.

-Batido de 1 vaso de leche desnatada con 10 cacahuetes sin tostar.

-Batido de 1 vaso de leche de soja con copos de avena.

-Batido con 2 vasos de agua puestos a hervir con una lata de atún natural.

-Batido de 1 vaso de leche desnatada con 10 almendras sin tostar y kiwi.

-Batido de 1 vaso de yogur líquido con 1 plátano y 5 anacardos.

Escuchando: The Beatles

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Batidos de proteínas

Batidos de proteínas
Batidos de proteínas
Debido a una consulta directa que he tenido sobre el tema, me gustaría dar unas pinceladas sobre el tema de estos suplementos.
La toma de batidos de proteínas no es para nada necesaria si se tiene el tiempo suficiente. Me explico: no se ha llegado a demostrar aún que un batido de proteínas sea mejor que un simple bocadillo de pollo o de pavo, por ejemplo. Sin embargo, si que es verdad que se da las cantidades de nutrientes óptimas para obtener buenos resultados en el ejercicio de musculación. La cantidad de proteína recomendada para una buena construcción muscular es de 2 gramos de proteína por kilogramo de peso corporal. Como es muy difícil calcular los gramos de proteínas en las comidas, los suplementos ayudan a la hora de controlarlo. Generalmente en los botes disponen de un cacillo que sirve de dispensador y que permite realizar ese cálculo fácilmente. No es bueno pasarse en las tomas de proteínas porque llegaríamos a saturar nuestro sistema de absorción y generaríamos un desajuste que conlleva a males menores como mal aliento (por no decir los fallos hepáticos y nefríticos).
En cuanto a los tipos de proteínas que se pueden encontrar en las tiendas de fitness, se podrían clasificar dependiendo de lo que se busca. La proteína de suero de leche es la que se utiliza justo antes de entrenar y después de entrenar. Si se quiere ganar peso, habrá que buscar un compuesto que sea alto en hidratos de carbono. Y cuando se quiere definir, las de mayor porcentaje en proteína serán las mejores (y las más caras, generalmente). Luego existen otros suplementos basados en caseína. Estos batidos son excelentes para tomarlos antes de acostarse, puesto que la caseína es de liberación lenta (cosa que no ocurre con la proteína de suero de leche, que es de asimilación rápida). De esta forma el cuerpo irá absorbiendo poco a poco la proteína y las reservas proteicas no se verán tan mermadas, no produciéndose en teoría la degeneración del tejido muscular.
Esto tan sólo ha sido una iniciación para los que tengan dudas sobre estos suplementos, que no son lo mismo que drogarse ni nada por el estilo. Si tenéis alguna duda más, no paséis la oportunidad de comentarla.

Escuchando: Podcast 59 de Macníacos

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