Enzyme X

febrero 18, 2010, publicado en Ciencia, Tecnología, escrito por doctorGENoma

Como ya anuncié en el último artículo sobre las enzimas de restricción, voy a presentar una aplicación para manejar endonucleasas de manera offline. Es un software desarrollado por el equipo de Mekentosj.com y se llama Enzyme X. Como ya preceden todas las aplicaciones destinadas a ciencia que hacen estos chicos (Alexander Griekspoor (Mek) y Tom Groothuis (Tosj)),recordad Papers o Lab Assistant, el interfaz está muy cuidado. Para mostrar como funciona, os dejo un video en el que simplemente cargo dos secuencias y dejo que encuentre las enzimas de restricción así como algunas de las utilidades que ofrece como referencias a las casas comerciales más importantes a nivel mundial, simulador de gel de electroforesis, el código genético aplicado a varias especies modelo, convertidor de concentraciones..etc. Incluso se tiene la posibilidad de hacer una búsqueda directamente en las bases de datos.
Imagen de previsualización de YouTube
Ver el vídeo en Vimeo
Esto es lo que más he utilizado ya que intento encontrar diferencias entre dos individuos concretos. Lo malo no es la aplicación sino que se necesita tener secuenciado la porción del genoma que se quiera estudiar con estas endonucleasas. Hay un pero: la aplicación está sólo disponible para Mac, pero hay otras aplicaciones en otros sistemas operativos que hacen cosas parecidas, aunque no tan cuidadas. Lo mejor de todo, que es gratuíto.
Espero que haya ayudado a algún intrépido científico maquero.


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