Legion desoxirribonucleica

#Photosinthelab Legión desoxirribonucleica (Offtopic: XIX Feria de la Ciencia)

Esta entrada dedicada a las #Photosinthelab la dedico a algo especial y que nos encanta a muchos científicos: las ferias de la ciencia. En esta ocasión, volvemos el equipo del Biobanco de Granada a darlo todo en la XIX Feria de la Ciencia que coincide con el vigésimo primer aniversario del Parque de las Ciencias de Granada, lugar donde se celebrará el evento en cuestión y que abre sus puertas de manera gratuita a todo el que quiera pasar.

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Extracción de ADN casera para docencia

Tras mi paso por innumerables ferias científicas, la extracción de ADN casera para docencia ha sido siempre un éxito. Aquí explicaré cómo realizarla paso a paso. Pero sin explicaciones. Eso os lo dejo por si hay suficientes visitas y comentarios.

Eso sí: os recuerdo a todos los profesionales de la enseñanza,que hay que documentarse bien para poder hablar sobre nuestro ácido más desoxirribonucleico y así mantener con la boca abierta el público.

MATERIAL NECESARIO:

  1. Agua embotellada.
  2. Vasos de plástico.
  3. Instrumento para verter volúmenes de unos 3 ml y poder absorber (por ejemplo, una pipeta Pasteur de plástico).
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Las mordeduras de serpiente son menos peligrosas

DNA-cobra

No es que las serpientes hayan ido perdiendo su peligrosidad o efectividad al actuar con sus colmillos. Las mordeduras de estos reptiles sí son un problema en determinados lugares del planeta y, sobre todo, afectan a gente con pocos recursos y conocimientos. La detección del tipo de veneno es clave para poder administrar un antídoto y cuanto más se sepa del atacante, menos peligrosa se vuelve su mordedura.

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Cambiando el código de la vida y los soportes digitales en @TrendingCiencia

Alfabeto Genético ampliado y bio-ordenadores
La nueva colaboración en Trending Ciencia, el podcast científico de moda, trata del último gran bombazo presentado en la revista Nature y publicado en su versión online el pasado 7 de mayo donde se explica la generación de un organismo semi-sintético en el que se ha ampliado su alfabeto genético añadiendo un par de bases nitrogenadas distintas a las cuatro del ADN (adenina, Guanina, Citosina y Timina).
Para terminar el programa de 7 minutos, una mención a la innovadora idea de utilizar el ADN como soporte digital. ¿Os imagináis cambiar los almacenamientos de información actuales por moléculas de ADN?.
Un programa que seguro no dejará a nadie indiferente.

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Mi experiencia en la supercomputación con Caléndula

Imagen de la parte externa del supercomputador Caléndula

Tras algún intento de probar la supercomputación para mi tesis doctoral, finalmente he podido tener acceso al servicio prestado por la Fundación del Centro de Supercomputación de Castilla y León donde pude disfrutar de darle a los comandos para usar algún que otro core de Caléndula, que así se llama el “monstruo” en cuestión.

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Foto actual del ADN

Imagen de varias moléculas de ADN mediante microscopía de transmisión de electrones
Aunque esto no es noticia puesto que fue publicado hace casi dos semanas, en el blog de un genetista esto es muy pero que muy relevante. Desde siempre la única foto “verdadera” del ADN eran las que se observaban gracias a la difracción de Rayos X (como la famosa imagen de Rosalind Franklin allá por los años 50 del siglo pasado -ver figura 1-).

Imagen de la doble hélice de ADN tomada mediante difracción de rayos X de 1952
Figura 1. Imagen de la doble hélice de ADN tomada mediante difracción de rayos X de 1952. Pulsar para agrandar
Ahora se ha conseguido sacar una instantánea de la doble hélice mediante microscopía electrónica. El trabajo se detalla en la publicación de Gentile y colaboradores del pasado 22 de noviembre y consiste en la obtención de la imagen mediante la suspensión de siete moléculas de ADN entre dos pivotes de silicio. En medio de esos pivotes se coloca un agujero por el que se hace pasar el haz de electrones que atravesará el objetivo a retratar: el ADN.
La verdad es que la foto (ver imagen de cabecera) no da una información muy obvia a simple vista pero, según se describe, se puede observar la periodicidad del enrollamiento de la doble hélice. En la imagen, las flechas en rojo señalan esas vueltas para así hacernos una idea de cómo estarían las moléculas “estiradas” de forma perpendicular a dichas marcas.

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Novedades en las búsquedas BLAST

Hace unos días me llegó la noticia de que la herramienta dedicada a las búsquedas BLAST en el NCBI se había actualizado ofreciendo novedades.
Al obtener los resultados aparece en la parte superior un enlace a un nuevo tipo de informe “View these results in the new enhanced report” junto otro enlace a un video de YouTube donde se detallan las nuevas opciones.

Entre ellas cabe destacar por su utilidad, la posibilidad de descargar únicamente las regiones de las secuencias de la base de datos que alinean con la nuestra, así como ver gráficamente alineamientos múltiples. Os animo a ver dicho vídeo explicativo de tres minutos:

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El Día del ADN

logo del DNA day
La celebración de este día es algo que realmente se lleva haciendo desde hace 9 años. Aunque los “DNAólogos” como yo lo llevemos celebrando desde que supimos la publicación de los señores Watson y Crick en Nature de la estructura del ADN allá por 1953 (aconsejo visitar las publicaciones del año pasado sobre el descubrimiento de la estructura del ADN, con vídeo, y la dedicada a la publicación en Nature ;)), los norteamericanos se quisieron adueñar de esa fecha por su aportación en el proyecto del genoma humano (ya que también terminó por esas fechas en 2003). En realidad no, “su día” no suele caer el mismo 25 de abril. Ya sabemos como son. Hacen fiesta nacional y chitón. Pero algo tan relevante no puede ser “secuestrado” por unos pocos. A lo largo y ancho del globo terráqueo se celebra ese 25 de abril como el Día Mundial del ADN.

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