Para los amantes del método científico creo que podéis pasar un buen rato con lo que os voy a presentar. Se trata del último episodio del podcast Decadencia Occidental, donde nos presentan (porque, al menos en mi caso, fue algo «exótico») «Mundo Desconocido» (punto com). Chemtrails, la extraña e INCOHERENTE evolución humana, los planetas huecos y algún que otro tema más son tratados aquí. Simplemente seguro que os hace pasar un buen rato. Yo me he reído bastante, aún sabiendo que hay gente que se cree estas cosas.
A parte del sentido común que caracteriza al podcast y que sirve sobradamente para desmontar todas estas conjeturas, Rubén, Óscar y Nacho se han servido de Carles y Óscar del podcast Geocastaway para opinar sobre las afirmaciones de la teoría de la tierra hueca. Además, yo también doy mi opinión sobre esa «interesantísima» teoría sobre la falsa evolución humana (ojo! que explica la aplicación de ingeniería genética por unos extraterrestres/dioses) y que tira por tierra nuestra coherencia científica con gran sabiduría (por no decir imaginación desbordante). Me hubiera gustado enviarles un audio, pero no tengo tiempo ni para enchufar el micro.
Si queréis pasar un buen rato, escuchad el podcast. Tomadlo a cachondeo, aunque haya detrás un gran número de seguidores de este individuo dando palmas. Si tenéis alguna opinión al respecto, ya sabéis cómo comentar. También podéis comentar en la entrada del podcast. (por cierto, no he puesto el enlace directo a dicha «web desconocida» porque no creo que tenga mérito alguno visitarla mediante este blog).
Durante varias décadas, el hongo patógeno Batrachochytrium dendrobatidis, ha diezmado poblaciones de ranas. Sin embargo, algunas de esas poblaciones y ciertas especies han sido capaces de resistir la enfermedad mortal, llamada quitridiomicosis.
Investigadores han identificado un mecanismo genético en las ranas leopardo que hace que algunas ranas sean resistentes a Batrachochytrium dendrobatidis. Descubrieron que la variación en un gen asociado con la capacidad de la rana para identificar agentes patógenos e iniciar una respuesta inmune puede determinar si una rana es resistente a la enfermedad. También encontraron la evidencia de que una forma (variante) del gen, que da inmunidad a la quitridiomicosis, ha sido seleccionada «positivamente» en las generaciones más recientes.
Los resultados ofrecen la esperanza de que las ranas puedan adaptarse a la enfermedad, siempre y cuando sus hábitats estén protegidos y su población crezca lo suficiente como para diversificar su herencia genética.
En este estudio, Anne Savage (el autor principal de un artículo publicado 26 de septiembre en las Actas de la Academia Nacional de Ciencias (PNAS), y que trabaja en el laboratorio de Kelly Zamudio, profesora de Cornell de Ecología y Biología evolutiva) pudo criar en el laboratorio ranas leopardo de cinco poblaciones distintas libres de enfermedad. A continuación, las poblaciones fueron infectadas con una cepa de Batrachochytrium dendrobatidis. Todas las ranas de tres de las poblaciones murieron. En los otros casos, siete ranas de cada una las dos poblaciones restantes sobrevivieron.
Ahora un poco de investigación en crudo: Savage analizó los genes del complejo mayor de histocompatibilidad, que codifican una molécula que se une a patógenos extraños e inicia una respuesta inmune en el huésped. En concreto, Savage secuenció los genes del complejo que controlan las regiones de unión de estas moléculas a los patógenos. Si la molécula y el hongo patógeno se unen, la rana sobrevive.
Se encontraron 33 alelos distintos (o distintas variantes de este gen del complejo), mostrándose una gran variabilidad. Casi todas las ranas que disponían las dos formas del gen (heterocigotos) sobrevivieron, mientras que casi la totalidad de las ranas con una sola forma (homocigotos) terminaron pereciendo. Dado que Batrachochytrium dendrobatidis tiene muchas proteínas que podrían ser reconocidas por las diferentes moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad, con más de una variante del gen pueden haber aumentado las posibilidades de supervivencia por la unión a los patógenos. Los investigadores también encontraron que una de las 33 variantes del gen, llamada alelo Q, se encontró sólo entre los supervivientes.
Curiosa y gran investigación utilizando una de las familias de genes más interesantes, aprovechándose de su carácter codominante, un tema muy presente y que tengo la suerte de tratar en mis estudios genéticos también.
Tras varios años participando y asistiendo a los congresos de la SEG, este año tan sólo puedo animar a su asistencia. Ya van 38 ediciones de este evento que se celebra cada dos años y que, en esta ocasión, la ciudad anfitriona es Murcia. Se celebrará esta semana, entre los días 21 y 23 de septiembre. Os dejo el programa para que le echéis un vistazo.
Desde mi punto de vista, la asistencia a congresos es algo muy rico tanto para pasar un buen rato con conocidos y nuevos amigos como a nivel profesional. Muchos sólo asisten a estos congresos «generales» cuando les interesa. Es algo asumible y de respetar. Pero, de vez en cuando, es bueno ver qué se cuece en otros campos de la Genética.
Por último, desear toda la suerte del mundo a algunos amigos y conocidos que sé que participarán como ponentes en esta edición y que me duele no poder asistir.Bueno, dejo caer la idea de hacer un life-streaming para que podamos disfrutar del congreso, al menos, los socios de la SEG. Ya me contaréis como ha ido.
Web del XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Genética
Mini-microscopio para iPhoneAcabo de recibir un correo de la empresa Invitrogen que «me anima» a realizar un pedido superior a 550 libras en el Reino Unido (unos 640€) y de 750€ en España. Añadiendo el número de catálogo MICROSCOPE se recibirá de forma gratis el mini-microscopio que se ve en la imagen. Además, si se quiere una camiseta con la doble hélice, se puede añadir también al pedido el número de catálogo HELIXT. La oferta es sólo para pedidos entre el 12 y el 16 de septiembre. Si alguien tiene que pedir algo con esos precios a Invitrogen, no dudéis en añadir los artículos (revisando las condiciones que están en letra pequeña)…y ya me contaréis que tal el aparatito.
Por cierto, el gadget cuesta alrededor de 13€ si lo queréis sin hacer pedidos. Lo podéis encontrar en la web de mobile.brando.com o por menos de 10€ (siempre sin gastos de envío) en meritline.com. Os dejo también una review del mini-microscopio y el vídeo de meritline.com.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=9Psey8TCFR0[/youtube]
Para terminar, os pongo un vídeo curioso de cómo hacer una lupa para un iPhone.
[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=fHieORuEsnQ[/youtube]
Como todos los años, la empresa de la manzana promociona sus equipos para que sean adquiridos a precios reducidos en el sector de la educación (profesores o alumnos que puedan demostrar que pertenecen a Colegios, Institutos o Universidades). Este año la oferta no es tan suculenta como en otras ocasiones -debe ser por lo bien que les va a los de Cupertino-. Se trata de una tarjeta de 75€ para las compras a realizar en las Mac App Store, el App Store y el iTunes Store. La oferta termina el próximo 20 de septiembre.
Recuerdo las personas que podrían beneficiarse del descuento educativo:
-Estudiantes universitarios o admitidos en una universidad.
-Padres que realicen un pedido para estudiantes universitarios o admitidos en una universidad
-Personal docente o administrativo de cualquier nivel de un centro educativo.
Este descuento es posible durante todo el año (excepto la promoción de la tarjeta) y las condiciones en cuanto al número de maquinitas con la manzanita por cada año son las siguientes:
-Ordenadores de sobremesa: uno (1) por año académico
-Mac mini: uno (1) por año académico
-Ordenadores portátiles: uno (1) por año académico
-Pantalla: un máximo de dos (2) por año académico
-Programas: un máximo de dos (2) por año académico
-Apple TV: sin límite
-iPod: sin límite.
Sigo diciendo que es el material perfecto para trabajar y ayuda mucho para ser más productivo. Y en el campo científico eso se nota. Además, se de buena tinta que Linux se lleva muy bien con estos ordenadores y aconsejo la virtualización para correr Windows (va mejor que nativamente con Boot camp).
Bueno, que no me paga Apple. Ahí queda el recordatorio.
Recuerdo que una de las primeras prácticas de Genética consistía en «jugar» con nuestro propio ADN para hacer algún análisis mediante estudios de PCR. Como veréis en el vídeo siguiente, una prueba de ADN para determinar la paternidad por ejemplo es sencilla. No es que sea un vídeo demasiado actual (tiene unos tres años) pero está desarrollado por una empresa que se dedica a realizar dichas pruebas y lo han hecho para captar clientes, así que es muy de cara al público y sin meterse en términos técnicos y sólo muestra lo que tiene que hacer el cliente para poder envíar las muestras. Además, puede ser gracioso por los términos utilizados ya que se trata de un servicio dado por una empresa estadounidense y está doblado como aquellos dibujos animados que veíamos de pequeños.
Muy «atrayente» eso de «descubra el poder de la prueba de ADN hoy». Parece más de un anuncio de detergentes.
Hay muchas empresas que se dedican a hacer este tipo de pruebas. Ésta en concreto lo hace por el «modico precio» de 169 dólares. En una de las prácticas de Bioquímica un profesor nos comentó que el presupuesto que se tenía para impartir dichas prácticas por alumno era de unos 6 euros. Sé de buena tinta que el profesor quería meternos algo de miedo porque en cursos anteriores se habían destrozado ciertos materiales y quería que tuviéramos cuidado, pero muy desencaminado no iba. He podido debatir sobre el tema con gente afín al campo de la Genética y, aunque los precios han bajado considerablemente, siguen siendo un negociazo este tipo de pruebas (a modo de ejemplo, observad estas tarifas de la empresa EasyDNA afincada en España).
¿Qué pensáis? ¿Veis razonable estas tarifas? ¿Creéis que se están favoreciendo de esa publicidad que dan las series de televisión?
Estuve dando un garbeo por las galerías de fotos que tenía guardadas sobre todo lo que hice a lo largo de la tesis y me encontré con un vídeo. Se trata de un recuerdo sobre cómo era el laboratorio donde trabajé en Hungría hace cuatro años. El vídeo tiene una pésima calidad, pero es lo máximo que se podía hacer con mi «flamante» Nokia N70 de aquella época. He podido añadir alguna etiqueta para que no sea muy aburrida la visita, pero sin añadir demasiadas, que sólo son 25 segundos. A ver si tengo tiempo y hago más vídeos.
La epigenética es uno de los campos que me apasionan y que está cobrando importancia en los últimos años. En esta ocasión, el artículo que voy a comentar puede llegar a tener un tono Lamarquista. Pero eso confirma lo complejo del diseño de la expresión génica, no vayamos a confundir ;-P. Investigadores del Centro John Innes de Norwich, en el Reino Unido, han hecho un descubrimiento que explica cómo un organismo puede crear una memoria biológica de ciertas variables tales como la calidad de la nutrición o la temperatura.
El descubrimiento explica el mecanismo de esta memoria – una especie de interruptor biológico – y la forma en que también pueden ser heredadas por la descendencia. El trabajo fue dirigido por el doctores Martin Howard y Caroline Dean recibiendo financiación del Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC).
La doctora Dean comentó que: «Hay muchos ejemplos que ahora sabemos donde la actividad de los genes pueden ser afectados a largo plazo por factores ambientales. Y en algunos casos, el medio ambiente en el que habita un individuo en realidad puede afectar a la biología o la fisiología de sus hijos, pero sin alterar la secuencia del genoma».
Por ejemplo, algunos estudios han demostrado que en las familias donde había una grave escasez de alimentos en la generación de los abuelos, los hijos y nietos tienen un mayor riesgo de enfermedad cardiovascular y diabetes, lo que podría explicarse por la memoria epigenética. Pero hasta ahora no ha habido un mecanismo claro para explicar cómo los individuos pueden desarrollar esa «memoria» de un factor variable, como la nutrición.
El equipo utilizó el ejemplo de cómo las plantas «recuerdan» la duración del período de invierno para que la polinización, el desarrollo, la dispersión de semillas y la germinación ocurra en el momento adecuado. Como casi siempre, Arabidopsis thaliana fue la especie vegetal elegida para indagar en este tema.
El doctor Howard advierte que: «Ya sabíamos mucho acerca de los genes implicados en la floración y estaba claro que algo pasa en el invierno que afecta al tiempo de floración, de acuerdo con la duración del período de frío».
Usando una combinación de modelos matemáticos y el análisis experimental, el equipo de investigación ha descubierto el sistema por el cual un gen clave llamado FLC esté desactivado o activado en cualquiera de sus células y, también, en su progenie. Encontraron que cuanto mayor sea el período de frío, mayor es la proporción de células que poseen el gen FLC estable y desactivado. Esto provoca un retraso la floración y se debe a un fenómeno conocido como memoria epigenética.
La memoria epigenética proviene de concretas modificaciones y una de las más importantes ocurre en las histonas (las proteínas alrededor de los cuales el ADN se envuelve). Ciertas modificaciones químicas que están en las histonas pueden afectar a la expresión de los genes cercanos, activándolos o desactivándolos (Aclaración no imprescindible que sirve de repaso: la cromatina está conformada por una unidad básica, el nucleosoma, conformado por histonas (H2A, H2B, H3 y H4) unidas a proteínas no histónicas. En el nucleosoma se enrolla el ADN. Por modificaciones post-traduccionales se puede modificar la configuración de las histonas. Las histonas sufren modificaciones por medio de procesos de acetilación, fosforilación, metilación, desaminación, isomerización de prolinas y ubiquitinización. Combinaciones específicas en la modificación de las histonas sirven como una especie de código que determina si el gen ha de ser silenciado o expresado y esta es otra forma de cómo se puede dar la regulación génica). Estas modificaciones pueden ser heredadas por las células hijas, cuando las células se dividen, y si se producen en las células que forman los gametos (por ejemplo, espermatozoides en mamíferos o el polen en las plantas), entonces también puede pasar a la descendencia.
Basándose en que cada nucleosoma abarca aproximadamente 175bp y que la longitud del gen FLC es de aproximadamente 6000bp del gen el número de nucleosomas es de unos 35. Cada uno de estos nucleosomas tiene dos copias de cada uno de los las histonas H2A, H2B, H3 y H4. Las modificaciones de las histonas que se cree que son clave en la memoria epigenética de vernalización están en la cola de la histona H3. De todas formas, existen 70 sitios diferentes que son capaces de aceptar las modificaciones. Imagen en la que se muestran los dos principales modificaciones epigenéticas. (Imagen: Nature 441, 143-145 (11 May 2006)).
El modelo matemático predijo que dentro de cada célula individual, el gen FLC debe estar completamente activado o silenciado, siendo mayor la proporción de células que pueden cambiar al estado «silenciado» cuanto más tiempo de frío.
Para evidenciar este hecho, se utilizó una técnica mediante la cual cualquier célula que tuviera el gen FLC activado aparecía de color azul bajo un microscopio. Según ellos, a partir de estas observaciones estaba claro que las células se encontraban activadas o desactivadas (en relación al gen FLC) en su totalidad, de acuerdo con la teoría. También se mostró que las histonas cercanas al gen FLC se encontraban modificadas durante el período de frío.
Para los que no conocíais este mundo epigenético, podéis observar lo complejos que somos los seres vivos. Os animo a que leais los otros artículos sobre este tema que fueron publicados aquí anteriormente y también el artículo «recién sacado del horno» en el blog Locos por la biología.
Durante estos últimos meses me veo inmerso en finalizar mi Tesis doctoral. Como muchos sabréis, el podcasting forma gran parte de mi día a día. Pues, hace un tiempo, tuve el honor de ser entrevistado por Sebas Oliva para su podcast Tecno. Y digo honor porque es todo un privilegio encontrarse en un programa en el que han participado gente como América Valenzuela, Juande Santander, Sonia Blanco, Isabel Iglesias, David Serantes..etc. por decir los más sonados a nivel nacional (que no me olvido de otros conocidos como SXenia, Joaquín García, Dani Aragay, Óscar J. Baeza, José María Ortiz, Ramón Rey, Roberto Tomás y el Profesor Bacterio).
Como ya comenté en un anterior post, este podcast está dedicado a conversar sobre el entorno tecnlógico en el que viven los entrevistados. En mi caso, damos un repaso a mis inicios en la tecnología y mi evolución en la misma. Así también comentamos las dos webs en las que estoy inmerso (cuando el tiempo me lo permite): blogdelaboratorio.com y lapodcastfera.net. Los que ya me conocen, no les va a extrañar nada de lo que oigan. Al resto, os animo a que nos escuchéis. Creo que no os aburriréis demasiado. Y no olvidéis de comentar (en cualquier sitio; Facebook, Twitter, Google plus, comentarios en los respectivos blogs, correo electrónico…como queráis) qué os ha parecido.
No. No voy a dedicar el artículo a hacer una descripción de cómo se vive entre probetas dentro del laboratorio. Sucede que existe un programa titulado así, «Entre probetas», y que lo aconsejo por dos cosas: la primera es que trata de Ciencia. Pero Ciencia explicada por José Antonio López, que…mejor os dejo su propia presentación que seguro es más descriptiva de lo que yo pueda relatar:
¿Quién dice que la Ciencia y, sobre todo, su Divulgación (ambas con mayúsculas) tienen que ser aburridas?¿Se puede divulgar e informar de los principales logros e hitos científicos sin dejar el humor, motor de vida, en el intento? Entre Probetas nació para informar. Entre Probetas surge para divertir. Entre Probetas describe, en apenas dos minutos, y en el tono desenfadado y directo que caracteriza a su autor, yo mismo, lo más destacado de la biología -en todas sus facetas-, medicina,tecnología o cualquier otra rama de la investigación humana. Mi labor como Profesor, Investigador y Director de Cultura Científica de uno de los mejores centros de investigación del país -Centro de Biología Molecular Severo Ochoa- me permite estar en primera línea informativa en áreas afines, o no tan afines, a mi propio desarrollo como científico; como biólogo molecular y microbiólogo.
Y la segunda es el tiempo, que ya habéis podido leer que son dos minutos. Así que no hace falta dedicarle mucho tiempo al tema ;).
El programa se emite en Radio Nacional de España 5 (RNE5) en los horarios siguientes: Lunes a Jueves 16.07; Sábado 14.52 y 19.52; Domingo 09.52 y 14.52. Pero para los que no puedan sintonizar la radio o les sea difícil escucharlo, tenéis el podcast para suscribirse y no perderse ningún programa. Toda la información la tenéis en la web del programa. Ya me contaréis si os gusta.
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